Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVFRD-1P60508 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVFRD-1P60508 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVFRD-1P60508 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVFRD-1P60508 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVFRD-1P60508 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVFRD-1P60508 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERVFRD-1P60508 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVFRD-1P60508 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVFRD-1P60508 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVFRD-1P60508 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVFRD-1P60508 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVFRD-1P60508 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVFRD-1P60508 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVFRD-1P60508 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVFRD-1P60508 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVFRD-1P60508 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVFRD-1P60508 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVFRD-1P60508 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVFRD-1P60508 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVFRD-1P60508 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVFRD-1P60508 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVFRD-1P60508 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVFRD-1P60508 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVFRD-1P60508 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVFRD-1P60508 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVFRD-1P60508 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVFRD-1P60508 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVFRD-1P60508 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFRD-1P60508 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVFRD-1P60508 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVFRD-1P60508 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVFRD-1P60508 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVFRD-1P60508 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFRD-1P60508 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFRD-1P60508 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFRD-1P60508 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFRD-1P60508 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFRD-1P60508 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERVFRD-1P60508 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERVFRD-1P60508 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVFRD-1P60508 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVFRD-1P60508 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVFRD-1P60508 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVFRD-1P60508 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFRD-1P60508 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVFRD-1P60508 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVFRD-1P60508 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVFRD-1P60508 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVFRD-1P60508 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVFRD-1P60508 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFRD-1P60508 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFRD-1P60508 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFRD-1P60508 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFRD-1P60508 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFRD-1P60508 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFRD-1P60508 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVFRD-1P60508 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVFRD-1P60508 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVFRD-1P60508 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVFRD-1P60508 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVFRD-1P60508 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVFRD-1P60508 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVFRD-1P60508 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVFRD-1P60508 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVFRD-1P60508 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVFRD-1P60508 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVFRD-1P60508 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVFRD-1P60508 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVFRD-1P60508 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVFRD-1P60508 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVFRD-1P60508 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVFRD-1P60508 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVFRD-1P60508 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVFRD-1P60508 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVFRD-1P60508 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVFRD-1P60508 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVFRD-1P60508 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVFRD-1P60508 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFRD-1P60508 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFRD-1P60508 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVFRD-1P60508 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVFRD-1P60508 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms