Protein–RNA interactions for Protein: P59826

BPIFB3, BPI fold-containing family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB3P59826 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFB3P59826 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFB3P59826 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFB3P59826 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFB3P59826 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFB3P59826 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFB3P59826 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFB3P59826 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFB3P59826 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFB3P59826 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BPIFB3P59826 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFB3P59826 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFB3P59826 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFB3P59826 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFB3P59826 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFB3P59826 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFB3P59826 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFB3P59826 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFB3P59826 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFB3P59826 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFB3P59826 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFB3P59826 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFB3P59826 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFB3P59826 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFB3P59826 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFB3P59826 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFB3P59826 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFB3P59826 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFB3P59826 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFB3P59826 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFB3P59826 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFB3P59826 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFB3P59826 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFB3P59826 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFB3P59826 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFB3P59826 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFB3P59826 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFB3P59826 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIFB3P59826 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPIFB3P59826 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFB3P59826 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFB3P59826 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFB3P59826 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFB3P59826 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFB3P59826 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFB3P59826 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFB3P59826 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFB3P59826 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFB3P59826 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFB3P59826 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFB3P59826 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFB3P59826 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFB3P59826 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFB3P59826 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFB3P59826 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFB3P59826 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFB3P59826 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFB3P59826 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFB3P59826 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFB3P59826 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFB3P59826 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFB3P59826 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFB3P59826 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFB3P59826 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFB3P59826 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFB3P59826 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFB3P59826 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFB3P59826 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFB3P59826 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFB3P59826 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFB3P59826 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFB3P59826 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFB3P59826 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFB3P59826 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFB3P59826 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFB3P59826 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BPIFB3P59826 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BPIFB3P59826 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFB3P59826 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFB3P59826 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFB3P59826 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFB3P59826 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFB3P59826 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFB3P59826 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BPIFB3P59826 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms