Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHMP4BP1P59074 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHMP4BP1P59074 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHMP4BP1P59074 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHMP4BP1P59074 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHMP4BP1P59074 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHMP4BP1P59074 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CHMP4BP1P59074 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CHMP4BP1P59074 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CHMP4BP1P59074 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CHMP4BP1P59074 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CHMP4BP1P59074 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CHMP4BP1P59074 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHMP4BP1P59074 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHMP4BP1P59074 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHMP4BP1P59074 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHMP4BP1P59074 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHMP4BP1P59074 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHMP4BP1P59074 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHMP4BP1P59074 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHMP4BP1P59074 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHMP4BP1P59074 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHMP4BP1P59074 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CHMP4BP1P59074 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHMP4BP1P59074 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHMP4BP1P59074 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHMP4BP1P59074 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHMP4BP1P59074 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHMP4BP1P59074 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CHMP4BP1P59074 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHMP4BP1P59074 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHMP4BP1P59074 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHMP4BP1P59074 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHMP4BP1P59074 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHMP4BP1P59074 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHMP4BP1P59074 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHMP4BP1P59074 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHMP4BP1P59074 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHMP4BP1P59074 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHMP4BP1P59074 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CHMP4BP1P59074 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHMP4BP1P59074 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CHMP4BP1P59074 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHMP4BP1P59074 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHMP4BP1P59074 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHMP4BP1P59074 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHMP4BP1P59074 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHMP4BP1P59074 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHMP4BP1P59074 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHMP4BP1P59074 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHMP4BP1P59074 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHMP4BP1P59074 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHMP4BP1P59074 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHMP4BP1P59074 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHMP4BP1P59074 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHMP4BP1P59074 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHMP4BP1P59074 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHMP4BP1P59074 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHMP4BP1P59074 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHMP4BP1P59074 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHMP4BP1P59074 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHMP4BP1P59074 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CHMP4BP1P59074 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHMP4BP1P59074 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHMP4BP1P59074 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CHMP4BP1P59074 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHMP4BP1P59074 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CHMP4BP1P59074 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CHMP4BP1P59074 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CHMP4BP1P59074 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CHMP4BP1P59074 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CHMP4BP1P59074 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CHMP4BP1P59074 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CHMP4BP1P59074 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CHMP4BP1P59074 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHMP4BP1P59074 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHMP4BP1P59074 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHMP4BP1P59074 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
CHMP4BP1P59074 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CHMP4BP1P59074 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHMP4BP1P59074 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHMP4BP1P59074 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHMP4BP1P59074 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHMP4BP1P59074 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHMP4BP1P59074 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHMP4BP1P59074 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHMP4BP1P59074 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHMP4BP1P59074 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHMP4BP1P59074 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CHMP4BP1P59074 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CHMP4BP1P59074 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHMP4BP1P59074 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHMP4BP1P59074 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHMP4BP1P59074 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHMP4BP1P59074 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHMP4BP1P59074 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHMP4BP1P59074 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CHMP4BP1P59074 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHMP4BP1P59074 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHMP4BP1P59074 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms