Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EDDM3BP56851 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDDM3BP56851 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDDM3BP56851 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDDM3BP56851 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDDM3BP56851 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDDM3BP56851 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDDM3BP56851 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDDM3BP56851 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDDM3BP56851 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDDM3BP56851 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDDM3BP56851 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDDM3BP56851 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDDM3BP56851 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDDM3BP56851 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDDM3BP56851 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDDM3BP56851 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDDM3BP56851 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDDM3BP56851 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDDM3BP56851 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDDM3BP56851 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDDM3BP56851 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDDM3BP56851 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDDM3BP56851 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDDM3BP56851 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDDM3BP56851 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDDM3BP56851 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDDM3BP56851 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDDM3BP56851 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDDM3BP56851 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDDM3BP56851 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDDM3BP56851 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDDM3BP56851 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDDM3BP56851 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDDM3BP56851 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDDM3BP56851 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDDM3BP56851 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDDM3BP56851 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDDM3BP56851 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDDM3BP56851 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDDM3BP56851 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDDM3BP56851 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDDM3BP56851 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDDM3BP56851 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDDM3BP56851 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDDM3BP56851 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDDM3BP56851 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDDM3BP56851 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDDM3BP56851 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDDM3BP56851 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDDM3BP56851 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDDM3BP56851 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDDM3BP56851 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDDM3BP56851 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EDDM3BP56851 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDDM3BP56851 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDDM3BP56851 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDDM3BP56851 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EDDM3BP56851 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDDM3BP56851 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDDM3BP56851 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDDM3BP56851 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDDM3BP56851 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDDM3BP56851 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDDM3BP56851 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDDM3BP56851 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDDM3BP56851 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDDM3BP56851 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDDM3BP56851 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDDM3BP56851 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDDM3BP56851 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDDM3BP56851 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDDM3BP56851 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDDM3BP56851 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDDM3BP56851 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDDM3BP56851 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDDM3BP56851 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDDM3BP56851 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDDM3BP56851 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDDM3BP56851 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDDM3BP56851 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDDM3BP56851 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EDDM3BP56851 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDDM3BP56851 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDDM3BP56851 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDDM3BP56851 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDDM3BP56851 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDDM3BP56851 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDDM3BP56851 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDDM3BP56851 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDDM3BP56851 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDDM3BP56851 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDDM3BP56851 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDDM3BP56851 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDDM3BP56851 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDDM3BP56851 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDDM3BP56851 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDDM3BP56851 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDDM3BP56851 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDDM3BP56851 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms