Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TPD52P55327 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TPD52P55327 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TPD52P55327 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TPD52P55327 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TPD52P55327 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TPD52P55327 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TPD52P55327 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TPD52P55327 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPD52P55327 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TPD52P55327 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TPD52P55327 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TPD52P55327 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPD52P55327 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPD52P55327 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TPD52P55327 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TPD52P55327 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TPD52P55327 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPD52P55327 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPD52P55327 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TPD52P55327 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPD52P55327 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPD52P55327 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TPD52P55327 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPD52P55327 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPD52P55327 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPD52P55327 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPD52P55327 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPD52P55327 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPD52P55327 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPD52P55327 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPD52P55327 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPD52P55327 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPD52P55327 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TPD52P55327 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TPD52P55327 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPD52P55327 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPD52P55327 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPD52P55327 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPD52P55327 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPD52P55327 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPD52P55327 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPD52P55327 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TPD52P55327 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPD52P55327 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPD52P55327 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPD52P55327 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPD52P55327 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPD52P55327 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPD52P55327 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPD52P55327 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPD52P55327 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPD52P55327 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TPD52P55327 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TPD52P55327 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPD52P55327 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPD52P55327 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPD52P55327 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPD52P55327 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPD52P55327 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPD52P55327 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPD52P55327 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPD52P55327 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPD52P55327 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPD52P55327 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPD52P55327 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPD52P55327 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPD52P55327 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPD52P55327 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TPD52P55327 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPD52P55327 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPD52P55327 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPD52P55327 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPD52P55327 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPD52P55327 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPD52P55327 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPD52P55327 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPD52P55327 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPD52P55327 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPD52P55327 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPD52P55327 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPD52P55327 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPD52P55327 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPD52P55327 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPD52P55327 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPD52P55327 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPD52P55327 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPD52P55327 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPD52P55327 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPD52P55327 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPD52P55327 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPD52P55327 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPD52P55327 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPD52P55327 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPD52P55327 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPD52P55327 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPD52P55327 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPD52P55327 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPD52P55327 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPD52P55327 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms