Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2JP52435 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR2JP52435 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR2JP52435 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR2JP52435 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR2JP52435 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2JP52435 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR2JP52435 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR2JP52435 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR2JP52435 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2JP52435 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2JP52435 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2JP52435 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2JP52435 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2JP52435 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2JP52435 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR2JP52435 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR2JP52435 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2JP52435 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2JP52435 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2JP52435 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2JP52435 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2JP52435 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2JP52435 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2JP52435 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2JP52435 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2JP52435 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2JP52435 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2JP52435 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2JP52435 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2JP52435 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2JP52435 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2JP52435 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2JP52435 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2JP52435 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2JP52435 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2JP52435 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2JP52435 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2JP52435 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR2JP52435 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2JP52435 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2JP52435 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2JP52435 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2JP52435 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2JP52435 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2JP52435 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2JP52435 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR2JP52435 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2JP52435 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2JP52435 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2JP52435 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2JP52435 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2JP52435 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2JP52435 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2JP52435 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2JP52435 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2JP52435 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2JP52435 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2JP52435 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2JP52435 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2JP52435 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2JP52435 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2JP52435 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2JP52435 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2JP52435 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2JP52435 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2JP52435 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2JP52435 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2JP52435 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR2JP52435 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2JP52435 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2JP52435 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2JP52435 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR2JP52435 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR2JP52435 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR2JP52435 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2JP52435 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2JP52435 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR2JP52435 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2JP52435 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR2JP52435 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR2JP52435 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR2JP52435 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2JP52435 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR2JP52435 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2JP52435 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2JP52435 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR2JP52435 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2JP52435 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2JP52435 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR2JP52435 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR2JP52435 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR2JP52435 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2JP52435 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR2JP52435 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR2JP52435 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR2JP52435 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR2JP52435 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR2JP52435 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR2JP52435 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.2 ms