Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PGDP52209 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGDP52209 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGDP52209 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGDP52209 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGDP52209 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGDP52209 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PGDP52209 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGDP52209 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PGDP52209 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGDP52209 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGDP52209 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PGDP52209 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGDP52209 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGDP52209 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGDP52209 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGDP52209 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGDP52209 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGDP52209 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PGDP52209 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PGDP52209 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGDP52209 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGDP52209 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGDP52209 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PGDP52209 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGDP52209 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGDP52209 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PGDP52209 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGDP52209 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGDP52209 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGDP52209 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGDP52209 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGDP52209 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PGDP52209 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGDP52209 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGDP52209 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGDP52209 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGDP52209 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGDP52209 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGDP52209 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGDP52209 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGDP52209 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGDP52209 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGDP52209 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGDP52209 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGDP52209 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGDP52209 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PGDP52209 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGDP52209 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGDP52209 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGDP52209 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGDP52209 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGDP52209 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGDP52209 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGDP52209 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGDP52209 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PGDP52209 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGDP52209 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGDP52209 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGDP52209 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGDP52209 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGDP52209 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGDP52209 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGDP52209 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGDP52209 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGDP52209 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGDP52209 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGDP52209 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGDP52209 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGDP52209 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGDP52209 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGDP52209 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGDP52209 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGDP52209 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGDP52209 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGDP52209 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PGDP52209 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGDP52209 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGDP52209 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PGDP52209 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGDP52209 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PGDP52209 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PGDP52209 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PGDP52209 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGDP52209 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PGDP52209 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGDP52209 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGDP52209 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGDP52209 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGDP52209 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGDP52209 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGDP52209 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGDP52209 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGDP52209 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGDP52209 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PGDP52209 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGDP52209 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGDP52209 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGDP52209 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGDP52209 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms