Protein–RNA interactions for Protein: P50086

NAS6, Probable 26S proteasome regulatory subunit p28, yeastyeast

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NAS6P50086 YBR220CYBR220C 1683 nt11.95□□□□□ -0.5
NAS6P50086 GFD2YCL036W 1701 nt11.91□□□□□ -0.5
NAS6P50086 SDH1YKL148C 1923 nt11.9□□□□□ -0.5
NAS6P50086 BDF1YLR399C 2061 nt11.9□□□□□ -0.5
NAS6P50086 IRC15YPL017C 1500 nt11.88□□□□□ -0.51
NAS6P50086 YOL037CYOL037C 354 nt11.88□□□□□ -0.51
NAS6P50086 NVJ2YPR091C 2313 nt11.87□□□□□ -0.51
NAS6P50086 RTS2YOR077W 699 nt11.87□□□□□ -0.51
NAS6P50086 PET9YBL030C 957 nt11.86□□□□□ -0.51
NAS6P50086 TIR4YOR009W 1464 nt11.85□□□□□ -0.51
NAS6P50086 NPL3YDR432W 1245 nt11.85□□□□□ -0.51
NAS6P50086 YOR139CYOR139C 393 nt11.83□□□□□ -0.52
NAS6P50086 SCC4YER147C 1875 nt11.83□□□□□ -0.52
NAS6P50086 GIS3YLR094C 1509 nt11.82□□□□□ -0.52
NAS6P50086 YJL152WYJL152W 360 nt11.81□□□□□ -0.52
NAS6P50086 YCH1YGR203W 447 nt11.8□□□□□ -0.52
NAS6P50086 YMR057CYMR057C 372 nt11.78□□□□□ -0.52
NAS6P50086 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.77□□□□□ -0.53
NAS6P50086 TAT1YBR069C 1860 nt11.76□□□□□ -0.53
NAS6P50086 CUE1YMR264W 612 nt11.7□□□□□ -0.54
NAS6P50086 WHI5YOR083W 888 nt11.65□□□□□ -0.54
NAS6P50086 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.63□□□□□ -0.55
NAS6P50086 YIL100WYIL100W 354 nt11.61□□□□□ -0.55
NAS6P50086 YLR281CYLR281C 468 nt11.61□□□□□ -0.55
NAS6P50086 FPS1YLL043W 2010 nt11.59□□□□□ -0.55
NAS6P50086 YSC84YHR016C 1407 nt11.58□□□□□ -0.56
NAS6P50086 SEC11YIR022W 504 nt11.57□□□□□ -0.56
NAS6P50086 YLR236CYLR236C 324 nt11.57□□□□□ -0.56
NAS6P50086 YNL195CYNL195C 786 nt11.55□□□□□ -0.56
NAS6P50086 PCH2YBR186W 1695 nt11.52□□□□□ -0.56
NAS6P50086 RRT12YCR045C 1476 nt11.51□□□□□ -0.57
NAS6P50086 PUS2YGL063W 1113 nt11.48□□□□□ -0.57
NAS6P50086 IDH1YNL037C 1083 nt11.48□□□□□ -0.57
NAS6P50086 YHL050CYHL050C 2094 nt11.46□□□□□ -0.57
NAS6P50086 GUT2YIL155C 1950 nt11.45□□□□□ -0.58
NAS6P50086 GBP2YCL011C 1284 nt11.43□□□□□ -0.58
NAS6P50086 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.39□□□□□ -0.59
NAS6P50086 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.39□□□□□ -0.59
NAS6P50086 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.39□□□□□ -0.59
NAS6P50086 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.39□□□□□ -0.59
NAS6P50086 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.39□□□□□ -0.59
NAS6P50086 DSK2YMR276W 1122 nt11.37□□□□□ -0.59
NAS6P50086 IMP2'YIL154C 1041 nt11.36□□□□□ -0.59
NAS6P50086 TCD2YKL027W 1344 nt11.33□□□□□ -0.6
NAS6P50086 YDR433WYDR433W 441 nt11.31□□□□□ -0.6
NAS6P50086 RRD1YIL153W 1182 nt11.31□□□□□ -0.6
NAS6P50086 YPR011CYPR011C 981 nt11.27□□□□□ -0.61
NAS6P50086 RTF1YGL244W 1677 nt11.27□□□□□ -0.61
NAS6P50086 BOP3YNL042W 1191 nt11.24□□□□□ -0.61
NAS6P50086 MXR2YCL033C 507 nt11.23□□□□□ -0.61
NAS6P50086 DED1YOR204W 1815 nt11.23□□□□□ -0.61
NAS6P50086 FMP45YDL222C 930 nt11.21□□□□□ -0.61
NAS6P50086 PIB2YGL023C 1908 nt11.2□□□□□ -0.62
NAS6P50086 FMP52YER004W 696 nt11.19□□□□□ -0.62
NAS6P50086 FMT1YBL013W 1206 nt11.17□□□□□ -0.62
NAS6P50086 LPX1YOR084W 1164 nt11.17□□□□□ -0.62
NAS6P50086 CWP1YKL096W 720 nt11.15□□□□□ -0.62
NAS6P50086 PCM1YEL058W 1674 nt11.14□□□□□ -0.63
NAS6P50086 ERV46YAL042W 1248 nt11.12□□□□□ -0.63
NAS6P50086 ADH2YMR303C 1047 nt11.11□□□□□ -0.63
NAS6P50086 YCL042WYCL042W 360 nt11.11□□□□□ -0.63
NAS6P50086 YKR040CYKR040C 504 nt11.1□□□□□ -0.63
NAS6P50086 LCB1YMR296C 1677 nt11.1□□□□□ -0.63
NAS6P50086 SIM1YIL123W 1431 nt11.09□□□□□ -0.63
NAS6P50086 SNF6YHL025W 999 nt11.08□□□□□ -0.64
NAS6P50086 NCP1YHR042W 2076 nt11.07□□□□□ -0.64
NAS6P50086 PTK1YKL198C 1989 nt11.05□□□□□ -0.64
NAS6P50086 SOR2YDL246C 1074 nt11.03□□□□□ -0.64
NAS6P50086 SOR1YJR159W 1074 nt11.03□□□□□ -0.64
NAS6P50086 UME6YDR207C 2511 nt11□□□□□ -0.65
NAS6P50086 FRD1YEL047C 1413 nt11□□□□□ -0.65
NAS6P50086 BIO4YNR057C 714 nt10.98□□□□□ -0.65
NAS6P50086 Q0182Q0182 405 nt10.97□□□□□ -0.65
NAS6P50086 YFL054CYFL054C 1941 nt10.94□□□□□ -0.66
NAS6P50086 YIH1YCR059C 777 nt10.88□□□□□ -0.67
NAS6P50086 YLL053CYLL053C 459 nt10.86□□□□□ -0.67
NAS6P50086 SPP1YPL138C 1062 nt10.86□□□□□ -0.67
NAS6P50086 RNQ1YCL028W 1218 nt10.86□□□□□ -0.67
NAS6P50086 MOT3YMR070W 1473 nt10.85□□□□□ -0.67
NAS6P50086 PTH1YHR189W 573 nt10.83□□□□□ -0.68
NAS6P50086 ERF2YLR246W 1080 nt10.83□□□□□ -0.68
NAS6P50086 DIC1YLR348C 897 nt10.83□□□□□ -0.68
NAS6P50086 LYS4YDR234W 2082 nt10.81□□□□□ -0.68
NAS6P50086 SPT8YLR055C 1809 nt10.78□□□□□ -0.68
NAS6P50086 CRR1YLR213C 1269 nt10.77□□□□□ -0.69
NAS6P50086 FTR1YER145C 1215 nt10.75□□□□□ -0.69
NAS6P50086 ATF2YGR177C 1608 nt10.74□□□□□ -0.69
NAS6P50086 YLR235CYLR235C 399 nt10.73□□□□□ -0.69
NAS6P50086 TRM5YHR070W 1500 nt10.73□□□□□ -0.69
NAS6P50086 HEM12YDR047W 1089 nt10.72□□□□□ -0.69
NAS6P50086 YFL067WYFL067W 528 nt10.71□□□□□ -0.69
NAS6P50086 DDR2YOL052C-A 186 nt10.71□□□□□ -0.69
NAS6P50086 GAL1YBR020W 1587 nt10.71□□□□□ -0.69
NAS6P50086 TIM23YNR017W 669 nt10.69□□□□□ -0.7
NAS6P50086 MIC10YCL057C-A 294 nt10.69□□□□□ -0.7
NAS6P50086 YLR179CYLR179C 606 nt10.66□□□□□ -0.7
NAS6P50086 SNG1YGR197C 1644 nt10.66□□□□□ -0.7
NAS6P50086 SWE1YJL187C 2460 nt10.64□□□□□ -0.71
NAS6P50086 BOR1YNL275W 1731 nt10.62□□□□□ -0.71
NAS6P50086 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.2 ms