Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POU3F4P49335 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POU3F4P49335 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POU3F4P49335 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POU3F4P49335 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POU3F4P49335 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POU3F4P49335 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POU3F4P49335 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POU3F4P49335 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POU3F4P49335 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POU3F4P49335 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POU3F4P49335 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POU3F4P49335 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POU3F4P49335 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POU3F4P49335 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POU3F4P49335 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POU3F4P49335 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POU3F4P49335 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POU3F4P49335 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU3F4P49335 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POU3F4P49335 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POU3F4P49335 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POU3F4P49335 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POU3F4P49335 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POU3F4P49335 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POU3F4P49335 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POU3F4P49335 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POU3F4P49335 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POU3F4P49335 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POU3F4P49335 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POU3F4P49335 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POU3F4P49335 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POU3F4P49335 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POU3F4P49335 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POU3F4P49335 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POU3F4P49335 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POU3F4P49335 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POU3F4P49335 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POU3F4P49335 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POU3F4P49335 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POU3F4P49335 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POU3F4P49335 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POU3F4P49335 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POU3F4P49335 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POU3F4P49335 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POU3F4P49335 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POU3F4P49335 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POU3F4P49335 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POU3F4P49335 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POU3F4P49335 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POU3F4P49335 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POU3F4P49335 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POU3F4P49335 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POU3F4P49335 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POU3F4P49335 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POU3F4P49335 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POU3F4P49335 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POU3F4P49335 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POU3F4P49335 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU3F4P49335 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POU3F4P49335 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POU3F4P49335 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POU3F4P49335 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POU3F4P49335 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POU3F4P49335 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POU3F4P49335 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POU3F4P49335 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POU3F4P49335 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POU3F4P49335 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POU3F4P49335 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU3F4P49335 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU3F4P49335 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POU3F4P49335 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POU3F4P49335 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POU3F4P49335 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POU3F4P49335 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POU3F4P49335 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POU3F4P49335 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POU3F4P49335 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POU3F4P49335 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POU3F4P49335 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POU3F4P49335 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POU3F4P49335 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POU3F4P49335 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POU3F4P49335 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POU3F4P49335 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POU3F4P49335 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POU3F4P49335 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POU3F4P49335 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POU3F4P49335 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POU3F4P49335 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POU3F4P49335 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POU3F4P49335 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POU3F4P49335 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POU3F4P49335 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU3F4P49335 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU3F4P49335 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU3F4P49335 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POU3F4P49335 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POU3F4P49335 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms