Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRA2P47869 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRA2P47869 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA2P47869 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRA2P47869 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRA2P47869 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRA2P47869 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRA2P47869 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRA2P47869 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRA2P47869 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRA2P47869 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRA2P47869 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA2P47869 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRA2P47869 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRA2P47869 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA2P47869 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRA2P47869 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRA2P47869 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GABRA2P47869 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA2P47869 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA2P47869 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRA2P47869 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRA2P47869 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA2P47869 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA2P47869 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRA2P47869 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRA2P47869 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA2P47869 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA2P47869 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA2P47869 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRA2P47869 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRA2P47869 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRA2P47869 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRA2P47869 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA2P47869 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRA2P47869 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRA2P47869 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRA2P47869 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRA2P47869 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRA2P47869 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRA2P47869 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRA2P47869 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRA2P47869 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRA2P47869 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRA2P47869 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRA2P47869 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRA2P47869 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRA2P47869 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRA2P47869 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRA2P47869 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRA2P47869 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRA2P47869 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRA2P47869 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRA2P47869 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRA2P47869 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRA2P47869 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRA2P47869 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GABRA2P47869 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRA2P47869 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRA2P47869 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRA2P47869 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRA2P47869 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA2P47869 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRA2P47869 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA2P47869 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA2P47869 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA2P47869 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA2P47869 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA2P47869 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA2P47869 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA2P47869 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA2P47869 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA2P47869 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA2P47869 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA2P47869 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA2P47869 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA2P47869 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA2P47869 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRA2P47869 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRA2P47869 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRA2P47869 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA2P47869 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRA2P47869 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA2P47869 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRA2P47869 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms