Protein–RNA interactions for Protein: P46098

HTR3A, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3AP46098 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTR3AP46098 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HTR3AP46098 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTR3AP46098 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR3AP46098 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTR3AP46098 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HTR3AP46098 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HTR3AP46098 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTR3AP46098 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTR3AP46098 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HTR3AP46098 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTR3AP46098 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTR3AP46098 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTR3AP46098 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTR3AP46098 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTR3AP46098 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTR3AP46098 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HTR3AP46098 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTR3AP46098 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTR3AP46098 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTR3AP46098 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTR3AP46098 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTR3AP46098 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTR3AP46098 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTR3AP46098 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTR3AP46098 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTR3AP46098 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTR3AP46098 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTR3AP46098 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTR3AP46098 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTR3AP46098 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTR3AP46098 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTR3AP46098 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HTR3AP46098 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR3AP46098 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR3AP46098 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR3AP46098 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR3AP46098 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HTR3AP46098 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTR3AP46098 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTR3AP46098 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HTR3AP46098 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HTR3AP46098 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HTR3AP46098 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HTR3AP46098 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTR3AP46098 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTR3AP46098 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTR3AP46098 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTR3AP46098 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTR3AP46098 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTR3AP46098 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTR3AP46098 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTR3AP46098 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTR3AP46098 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTR3AP46098 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTR3AP46098 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTR3AP46098 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTR3AP46098 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTR3AP46098 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR3AP46098 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR3AP46098 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTR3AP46098 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR3AP46098 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR3AP46098 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR3AP46098 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR3AP46098 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR3AP46098 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR3AP46098 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTR3AP46098 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTR3AP46098 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTR3AP46098 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR3AP46098 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR3AP46098 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTR3AP46098 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTR3AP46098 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTR3AP46098 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTR3AP46098 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTR3AP46098 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTR3AP46098 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTR3AP46098 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTR3AP46098 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTR3AP46098 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTR3AP46098 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR3AP46098 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR3AP46098 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR3AP46098 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR3AP46098 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTR3AP46098 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTR3AP46098 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTR3AP46098 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTR3AP46098 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTR3AP46098 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTR3AP46098 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTR3AP46098 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTR3AP46098 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTR3AP46098 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTR3AP46098 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTR3AP46098 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTR3AP46098 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTR3AP46098 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms