Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NOP2P46087 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NOP2P46087 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NOP2P46087 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NOP2P46087 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NOP2P46087 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NOP2P46087 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
NOP2P46087 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NOP2P46087 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NOP2P46087 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NOP2P46087 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NOP2P46087 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NOP2P46087 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NOP2P46087 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NOP2P46087 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NOP2P46087 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NOP2P46087 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NOP2P46087 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NOP2P46087 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NOP2P46087 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NOP2P46087 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NOP2P46087 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NOP2P46087 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NOP2P46087 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NOP2P46087 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOP2P46087 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NOP2P46087 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NOP2P46087 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NOP2P46087 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NOP2P46087 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NOP2P46087 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NOP2P46087 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NOP2P46087 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NOP2P46087 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
NOP2P46087 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NOP2P46087 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NOP2P46087 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NOP2P46087 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NOP2P46087 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NOP2P46087 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NOP2P46087 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NOP2P46087 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NOP2P46087 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NOP2P46087 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NOP2P46087 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NOP2P46087 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NOP2P46087 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NOP2P46087 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NOP2P46087 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NOP2P46087 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NOP2P46087 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NOP2P46087 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOP2P46087 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOP2P46087 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NOP2P46087 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NOP2P46087 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
NOP2P46087 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NOP2P46087 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NOP2P46087 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NOP2P46087 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NOP2P46087 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NOP2P46087 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NOP2P46087 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NOP2P46087 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NOP2P46087 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NOP2P46087 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOP2P46087 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOP2P46087 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NOP2P46087 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NOP2P46087 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NOP2P46087 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NOP2P46087 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NOP2P46087 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NOP2P46087 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NOP2P46087 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NOP2P46087 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NOP2P46087 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NOP2P46087 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NOP2P46087 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NOP2P46087 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NOP2P46087 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NOP2P46087 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NOP2P46087 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOP2P46087 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOP2P46087 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NOP2P46087 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NOP2P46087 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOP2P46087 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NOP2P46087 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOP2P46087 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NOP2P46087 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NOP2P46087 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NOP2P46087 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NOP2P46087 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NOP2P46087 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NOP2P46087 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NOP2P46087 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NOP2P46087 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NOP2P46087 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NOP2P46087 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms