Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 YDL221WYDL221W 552 nt12.31□□□□□ -0.44
SEC28P40509 ART5YGR068C 1761 nt12.27□□□□□ -0.45
SEC28P40509 YOR139CYOR139C 393 nt12.26□□□□□ -0.45
SEC28P40509 GFD2YCL036W 1701 nt12.21□□□□□ -0.45
SEC28P40509 PET9YBL030C 957 nt12.2□□□□□ -0.46
SEC28P40509 YBR220CYBR220C 1683 nt12.19□□□□□ -0.46
SEC28P40509 YCH1YGR203W 447 nt12.19□□□□□ -0.46
SEC28P40509 SDH1YKL148C 1923 nt12.19□□□□□ -0.46
SEC28P40509 YJL152WYJL152W 360 nt12.17□□□□□ -0.46
SEC28P40509 TIR4YOR009W 1464 nt12.16□□□□□ -0.46
SEC28P40509 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.16□□□□□ -0.46
SEC28P40509 IRC15YPL017C 1500 nt12.15□□□□□ -0.46
SEC28P40509 RTS2YOR077W 699 nt12.13□□□□□ -0.47
SEC28P40509 BDF1YLR399C 2061 nt12.11□□□□□ -0.47
SEC28P40509 SCC4YER147C 1875 nt12.11□□□□□ -0.47
SEC28P40509 YMR057CYMR057C 372 nt12.09□□□□□ -0.47
SEC28P40509 GIS3YLR094C 1509 nt12.09□□□□□ -0.47
SEC28P40509 WHI5YOR083W 888 nt12.05□□□□□ -0.48
SEC28P40509 YLR281CYLR281C 468 nt12.03□□□□□ -0.48
SEC28P40509 MOT3YMR070W 1473 nt12.02□□□□□ -0.49
SEC28P40509 CUE1YMR264W 612 nt12□□□□□ -0.49
SEC28P40509 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.99□□□□□ -0.49
SEC28P40509 FPS1YLL043W 2010 nt11.98□□□□□ -0.49
SEC28P40509 TAT1YBR069C 1860 nt11.97□□□□□ -0.49
SEC28P40509 YIL100WYIL100W 354 nt11.94□□□□□ -0.5
SEC28P40509 YLR236CYLR236C 324 nt11.92□□□□□ -0.5
SEC28P40509 PUS2YGL063W 1113 nt11.89□□□□□ -0.51
SEC28P40509 IDH1YNL037C 1083 nt11.87□□□□□ -0.51
SEC28P40509 YNL195CYNL195C 786 nt11.87□□□□□ -0.51
SEC28P40509 SEC11YIR022W 504 nt11.86□□□□□ -0.51
SEC28P40509 IMP2'YIL154C 1041 nt11.83□□□□□ -0.52
SEC28P40509 YSC84YHR016C 1407 nt11.83□□□□□ -0.52
SEC28P40509 NVJ2YPR091C 2313 nt11.82□□□□□ -0.52
SEC28P40509 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.82□□□□□ -0.52
SEC28P40509 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.82□□□□□ -0.52
SEC28P40509 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.82□□□□□ -0.52
SEC28P40509 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.82□□□□□ -0.52
SEC28P40509 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.82□□□□□ -0.52
SEC28P40509 DSK2YMR276W 1122 nt11.8□□□□□ -0.52
SEC28P40509 GBP2YCL011C 1284 nt11.79□□□□□ -0.52
SEC28P40509 PCH2YBR186W 1695 nt11.76□□□□□ -0.53
SEC28P40509 RRT12YCR045C 1476 nt11.75□□□□□ -0.53
SEC28P40509 YHL050CYHL050C 2094 nt11.71□□□□□ -0.53
SEC28P40509 PAC11YDR488C 1602 nt11.7□□□□□ -0.54
SEC28P40509 TCD2YKL027W 1344 nt11.69□□□□□ -0.54
SEC28P40509 YDR433WYDR433W 441 nt11.68□□□□□ -0.54
SEC28P40509 GUT2YIL155C 1950 nt11.67□□□□□ -0.54
SEC28P40509 RRD1YIL153W 1182 nt11.61□□□□□ -0.55
SEC28P40509 YPR011CYPR011C 981 nt11.61□□□□□ -0.55
SEC28P40509 FMP45YDL222C 930 nt11.6□□□□□ -0.55
SEC28P40509 FMP52YER004W 696 nt11.56□□□□□ -0.56
SEC28P40509 MXR2YCL033C 507 nt11.55□□□□□ -0.56
SEC28P40509 DED1YOR204W 1815 nt11.54□□□□□ -0.56
SEC28P40509 ERV46YAL042W 1248 nt11.52□□□□□ -0.57
SEC28P40509 LPX1YOR084W 1164 nt11.52□□□□□ -0.57
SEC28P40509 RTF1YGL244W 1677 nt11.51□□□□□ -0.57
SEC28P40509 BOP3YNL042W 1191 nt11.5□□□□□ -0.57
SEC28P40509 YKR040CYKR040C 504 nt11.49□□□□□ -0.57
SEC28P40509 YCL042WYCL042W 360 nt11.48□□□□□ -0.57
SEC28P40509 CWP1YKL096W 720 nt11.46□□□□□ -0.57
SEC28P40509 FMT1YBL013W 1206 nt11.45□□□□□ -0.58
SEC28P40509 PCM1YEL058W 1674 nt11.45□□□□□ -0.58
SEC28P40509 PIB2YGL023C 1908 nt11.41□□□□□ -0.58
SEC28P40509 SNF6YHL025W 999 nt11.41□□□□□ -0.58
SEC28P40509 ADH2YMR303C 1047 nt11.41□□□□□ -0.58
SEC28P40509 SIM1YIL123W 1431 nt11.38□□□□□ -0.59
SEC28P40509 SOR2YDL246C 1074 nt11.38□□□□□ -0.59
SEC28P40509 SOR1YJR159W 1074 nt11.38□□□□□ -0.59
SEC28P40509 LCB1YMR296C 1677 nt11.36□□□□□ -0.59
SEC28P40509 FRD1YEL047C 1413 nt11.33□□□□□ -0.6
SEC28P40509 NCP1YHR042W 2076 nt11.32□□□□□ -0.6
SEC28P40509 PTK1YKL198C 1989 nt11.27□□□□□ -0.61
SEC28P40509 BIO4YNR057C 714 nt11.26□□□□□ -0.61
SEC28P40509 YIH1YCR059C 777 nt11.2□□□□□ -0.62
SEC28P40509 SPP1YPL138C 1062 nt11.2□□□□□ -0.62
SEC28P40509 RNQ1YCL028W 1218 nt11.2□□□□□ -0.62
SEC28P40509 YFL054CYFL054C 1941 nt11.17□□□□□ -0.62
SEC28P40509 YLL053CYLL053C 459 nt11.16□□□□□ -0.62
SEC28P40509 DIC1YLR348C 897 nt11.16□□□□□ -0.62
SEC28P40509 PTH1YHR189W 573 nt11.15□□□□□ -0.62
SEC28P40509 ERF2YLR246W 1080 nt11.15□□□□□ -0.62
SEC28P40509 YLR235CYLR235C 399 nt11.13□□□□□ -0.63
SEC28P40509 LYS4YDR234W 2082 nt11.08□□□□□ -0.63
SEC28P40509 FTR1YER145C 1215 nt11.06□□□□□ -0.64
SEC28P40509 CRR1YLR213C 1269 nt11.06□□□□□ -0.64
SEC28P40509 YFL067WYFL067W 528 nt11.04□□□□□ -0.64
SEC28P40509 TIM23YNR017W 669 nt11.04□□□□□ -0.64
SEC28P40509 DDR2YOL052C-A 186 nt11.03□□□□□ -0.64
SEC28P40509 GAL1YBR020W 1587 nt11.03□□□□□ -0.64
SEC28P40509 TRM5YHR070W 1500 nt11.02□□□□□ -0.65
SEC28P40509 ATF2YGR177C 1608 nt11.02□□□□□ -0.65
SEC28P40509 SPT8YLR055C 1809 nt11.01□□□□□ -0.65
SEC28P40509 HEM12YDR047W 1089 nt11.01□□□□□ -0.65
SEC28P40509 YLR179CYLR179C 606 nt11.01□□□□□ -0.65
SEC28P40509 YKL030WYKL030W 606 nt11□□□□□ -0.65
SEC28P40509 AQY1YPR192W 918 nt10.98□□□□□ -0.65
SEC28P40509 YJL225CYJL225C 5277 nt10.97□□□□□ -0.65
SEC28P40509 MIC10YCL057C-A 294 nt10.93□□□□□ -0.66
SEC28P40509 SNG1YGR197C 1644 nt10.93□□□□□ -0.66
SEC28P40509 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.92□□□□□ -0.66
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