Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 ART5YGR068C 1761 nt13.37□□□□□ -0.27
VFA1P40080 GFD2YCL036W 1701 nt13.33□□□□□ -0.27
VFA1P40080 IRC15YPL017C 1500 nt13.33□□□□□ -0.28
VFA1P40080 SDH1YKL148C 1923 nt13.33□□□□□ -0.28
VFA1P40080 TIR4YOR009W 1464 nt13.26□□□□□ -0.29
VFA1P40080 RTS2YOR077W 699 nt13.26□□□□□ -0.29
VFA1P40080 TAT1YBR069C 1860 nt13.25□□□□□ -0.29
VFA1P40080 YOR139CYOR139C 393 nt13.25□□□□□ -0.29
VFA1P40080 YOL037CYOL037C 354 nt13.24□□□□□ -0.29
VFA1P40080 GIS3YLR094C 1509 nt13.23□□□□□ -0.29
VFA1P40080 PET9YBL030C 957 nt13.22□□□□□ -0.29
VFA1P40080 SCC4YER147C 1875 nt13.22□□□□□ -0.29
VFA1P40080 NPL3YDR432W 1245 nt13.18□□□□□ -0.3
VFA1P40080 YCH1YGR203W 447 nt13.14□□□□□ -0.31
VFA1P40080 YMR057CYMR057C 372 nt13.14□□□□□ -0.31
VFA1P40080 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.12□□□□□ -0.31
VFA1P40080 YJL152WYJL152W 360 nt13.11□□□□□ -0.31
VFA1P40080 CUE1YMR264W 612 nt13.06□□□□□ -0.32
VFA1P40080 FPS1YLL043W 2010 nt13□□□□□ -0.33
VFA1P40080 WHI5YOR083W 888 nt12.99□□□□□ -0.33
VFA1P40080 YLR281CYLR281C 468 nt12.97□□□□□ -0.33
VFA1P40080 YSC84YHR016C 1407 nt12.96□□□□□ -0.34
VFA1P40080 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.91□□□□□ -0.34
VFA1P40080 PCH2YBR186W 1695 nt12.9□□□□□ -0.34
VFA1P40080 YIL100WYIL100W 354 nt12.9□□□□□ -0.34
VFA1P40080 SEC11YIR022W 504 nt12.89□□□□□ -0.35
VFA1P40080 RRT12YCR045C 1476 nt12.88□□□□□ -0.35
VFA1P40080 YHL050CYHL050C 2094 nt12.88□□□□□ -0.35
VFA1P40080 YLR236CYLR236C 324 nt12.86□□□□□ -0.35
VFA1P40080 GUT2YIL155C 1950 nt12.84□□□□□ -0.35
VFA1P40080 YNL195CYNL195C 786 nt12.8□□□□□ -0.36
VFA1P40080 PUS2YGL063W 1113 nt12.78□□□□□ -0.36
VFA1P40080 IDH1YNL037C 1083 nt12.76□□□□□ -0.37
VFA1P40080 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.73□□□□□ -0.37
VFA1P40080 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.73□□□□□ -0.37
VFA1P40080 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.73□□□□□ -0.37
VFA1P40080 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.73□□□□□ -0.37
VFA1P40080 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.73□□□□□ -0.37
VFA1P40080 GBP2YCL011C 1284 nt12.71□□□□□ -0.37
VFA1P40080 DSK2YMR276W 1122 nt12.68□□□□□ -0.38
VFA1P40080 RRD1YIL153W 1182 nt12.67□□□□□ -0.38
VFA1P40080 PIB2YGL023C 1908 nt12.66□□□□□ -0.38
VFA1P40080 YPR011CYPR011C 981 nt12.66□□□□□ -0.38
VFA1P40080 IMP2'YIL154C 1041 nt12.63□□□□□ -0.39
VFA1P40080 DED1YOR204W 1815 nt12.61□□□□□ -0.39
VFA1P40080 RTF1YGL244W 1677 nt12.61□□□□□ -0.39
VFA1P40080 TCD2YKL027W 1344 nt12.59□□□□□ -0.39
VFA1P40080 YDR433WYDR433W 441 nt12.57□□□□□ -0.4
VFA1P40080 MXR2YCL033C 507 nt12.55□□□□□ -0.4
VFA1P40080 Q0182Q0182 405 nt12.54□□□□□ -0.4
VFA1P40080 FMP45YDL222C 930 nt12.53□□□□□ -0.4
VFA1P40080 FMT1YBL013W 1206 nt12.52□□□□□ -0.41
VFA1P40080 BOP3YNL042W 1191 nt12.52□□□□□ -0.41
VFA1P40080 LPX1YOR084W 1164 nt12.49□□□□□ -0.41
VFA1P40080 NCP1YHR042W 2076 nt12.49□□□□□ -0.41
VFA1P40080 FMP52YER004W 696 nt12.48□□□□□ -0.41
VFA1P40080 LCB1YMR296C 1677 nt12.46□□□□□ -0.41
VFA1P40080 PCM1YEL058W 1674 nt12.45□□□□□ -0.42
VFA1P40080 ERV46YAL042W 1248 nt12.44□□□□□ -0.42
VFA1P40080 CWP1YKL096W 720 nt12.43□□□□□ -0.42
VFA1P40080 PTK1YKL198C 1989 nt12.43□□□□□ -0.42
VFA1P40080 ADH2YMR303C 1047 nt12.42□□□□□ -0.42
VFA1P40080 YKR040CYKR040C 504 nt12.38□□□□□ -0.43
VFA1P40080 PAC11YDR488C 1602 nt12.35□□□□□ -0.43
VFA1P40080 SIM1YIL123W 1431 nt12.35□□□□□ -0.43
VFA1P40080 SOR2YDL246C 1074 nt12.34□□□□□ -0.43
VFA1P40080 SNF6YHL025W 999 nt12.34□□□□□ -0.43
VFA1P40080 SOR1YJR159W 1074 nt12.34□□□□□ -0.43
VFA1P40080 YCL042WYCL042W 360 nt12.34□□□□□ -0.43
VFA1P40080 FRD1YEL047C 1413 nt12.32□□□□□ -0.44
VFA1P40080 BIO4YNR057C 714 nt12.28□□□□□ -0.44
VFA1P40080 YFL054CYFL054C 1941 nt12.21□□□□□ -0.45
VFA1P40080 LYS4YDR234W 2082 nt12.18□□□□□ -0.46
VFA1P40080 YIH1YCR059C 777 nt12.17□□□□□ -0.46
VFA1P40080 SPP1YPL138C 1062 nt12.17□□□□□ -0.46
VFA1P40080 RNQ1YCL028W 1218 nt12.13□□□□□ -0.47
VFA1P40080 YLL053CYLL053C 459 nt12.12□□□□□ -0.47
VFA1P40080 MOT3YMR070W 1473 nt12.12□□□□□ -0.47
VFA1P40080 SPT8YLR055C 1809 nt12.09□□□□□ -0.47
VFA1P40080 DIC1YLR348C 897 nt12.09□□□□□ -0.47
VFA1P40080 PTH1YHR189W 573 nt12.07□□□□□ -0.48
VFA1P40080 ERF2YLR246W 1080 nt12.07□□□□□ -0.48
VFA1P40080 CRR1YLR213C 1269 nt12.05□□□□□ -0.48
VFA1P40080 ATF2YGR177C 1608 nt12.02□□□□□ -0.49
VFA1P40080 FTR1YER145C 1215 nt12□□□□□ -0.49
VFA1P40080 GAL1YBR020W 1587 nt11.98□□□□□ -0.49
VFA1P40080 TRM5YHR070W 1500 nt11.97□□□□□ -0.49
VFA1P40080 MIC10YCL057C-A 294 nt11.97□□□□□ -0.49
VFA1P40080 HEM12YDR047W 1089 nt11.94□□□□□ -0.5
VFA1P40080 YLR235CYLR235C 399 nt11.94□□□□□ -0.5
VFA1P40080 SWE1YJL187C 2460 nt11.93□□□□□ -0.5
VFA1P40080 YFL067WYFL067W 528 nt11.92□□□□□ -0.5
VFA1P40080 SNG1YGR197C 1644 nt11.92□□□□□ -0.5
VFA1P40080 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.9□□□□□ -0.5
VFA1P40080 TIM23YNR017W 669 nt11.9□□□□□ -0.5
VFA1P40080 DDR2YOL052C-A 186 nt11.89□□□□□ -0.51
VFA1P40080 YLR179CYLR179C 606 nt11.87□□□□□ -0.51
VFA1P40080 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.83□□□□□ -0.52
VFA1P40080 YKL030WYKL030W 606 nt11.83□□□□□ -0.52
VFA1P40080 AQY1YPR192W 918 nt11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.4 ms