Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 GIS3YLR094C 1509 nt11.58□□□□□ -0.56
YAR028WP39548 SHU1YHL006C 453 nt11.57□□□□□ -0.56
YAR028WP39548 HOM6YJR139C 1080 nt11.57□□□□□ -0.56
YAR028WP39548 GFD2YCL036W 1701 nt11.57□□□□□ -0.56
YAR028WP39548 ART5YGR068C 1761 nt11.56□□□□□ -0.56
YAR028WP39548 SEC11YIR022W 504 nt11.54□□□□□ -0.56
YAR028WP39548 PCH2YBR186W 1695 nt11.52□□□□□ -0.56
YAR028WP39548 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.51□□□□□ -0.57
YAR028WP39548 PET9YBL030C 957 nt11.5□□□□□ -0.57
YAR028WP39548 NME1NME1 340 nt11.48□□□□□ -0.57
YAR028WP39548 GUT2YIL155C 1950 nt11.48□□□□□ -0.57
YAR028WP39548 RTS2YOR077W 699 nt11.47□□□□□ -0.57
YAR028WP39548 MNP1YGL068W 585 nt11.43□□□□□ -0.58
YAR028WP39548 YCH1YGR203W 447 nt11.42□□□□□ -0.58
YAR028WP39548 YSC84YHR016C 1407 nt11.41□□□□□ -0.58
YAR028WP39548 RKM5YLR137W 1104 nt11.4□□□□□ -0.58
YAR028WP39548 CUE1YMR264W 612 nt11.39□□□□□ -0.59
YAR028WP39548 TIR4YOR009W 1464 nt11.38□□□□□ -0.59
YAR028WP39548 PAC11YDR488C 1602 nt11.36□□□□□ -0.59
YAR028WP39548 YGR139WYGR139W 339 nt11.36□□□□□ -0.59
YAR028WP39548 YHL050CYHL050C 2094 nt11.34□□□□□ -0.59
YAR028WP39548 YMR057CYMR057C 372 nt11.3□□□□□ -0.6
YAR028WP39548 PIB2YGL023C 1908 nt11.29□□□□□ -0.6
YAR028WP39548 RRT12YCR045C 1476 nt11.27□□□□□ -0.6
YAR028WP39548 YIL100WYIL100W 354 nt11.24□□□□□ -0.61
YAR028WP39548 YKL097CYKL097C 411 nt11.24□□□□□ -0.61
YAR028WP39548 YNL195CYNL195C 786 nt11.24□□□□□ -0.61
YAR028WP39548 FPS1YLL043W 2010 nt11.23□□□□□ -0.61
YAR028WP39548 NPL3YDR432W 1245 nt11.23□□□□□ -0.61
YAR028WP39548 RTF1YGL244W 1677 nt11.21□□□□□ -0.61
YAR028WP39548 YLR236CYLR236C 324 nt11.18□□□□□ -0.62
YAR028WP39548 BOP3YNL042W 1191 nt11.16□□□□□ -0.62
YAR028WP39548 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.15□□□□□ -0.62
YAR028WP39548 YJL152WYJL152W 360 nt11.13□□□□□ -0.63
YAR028WP39548 YOL037CYOL037C 354 nt11.09□□□□□ -0.63
YAR028WP39548 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.08□□□□□ -0.64
YAR028WP39548 PTK1YKL198C 1989 nt11.05□□□□□ -0.64
YAR028WP39548 YJL225CYJL225C 5277 nt11.01□□□□□ -0.65
YAR028WP39548 NCP1YHR042W 2076 nt11□□□□□ -0.65
YAR028WP39548 WHI5YOR083W 888 nt10.89□□□□□ -0.67
YAR028WP39548 YOR139CYOR139C 393 nt10.89□□□□□ -0.67
YAR028WP39548 NVJ2YPR091C 2313 nt10.88□□□□□ -0.67
YAR028WP39548 LCB1YMR296C 1677 nt10.86□□□□□ -0.67
YAR028WP39548 YLR281CYLR281C 468 nt10.86□□□□□ -0.67
YAR028WP39548 RRD1YIL153W 1182 nt10.85□□□□□ -0.67
YAR028WP39548 YFL054CYFL054C 1941 nt10.82□□□□□ -0.68
YAR028WP39548 IDH1YNL037C 1083 nt10.82□□□□□ -0.68
YAR028WP39548 FMP52YER004W 696 nt10.8□□□□□ -0.68
YAR028WP39548 GBP2YCL011C 1284 nt10.79□□□□□ -0.68
YAR028WP39548 SPT8YLR055C 1809 nt10.76□□□□□ -0.69
YAR028WP39548 DED1YOR204W 1815 nt10.75□□□□□ -0.69
YAR028WP39548 TCD2YKL027W 1344 nt10.73□□□□□ -0.69
YAR028WP39548 PCM1YEL058W 1674 nt10.73□□□□□ -0.69
YAR028WP39548 SIM1YIL123W 1431 nt10.71□□□□□ -0.69
YAR028WP39548 FMT1YBL013W 1206 nt10.7□□□□□ -0.7
YAR028WP39548 IMP2'YIL154C 1041 nt10.67□□□□□ -0.7
YAR028WP39548 LYS4YDR234W 2082 nt10.64□□□□□ -0.71
YAR028WP39548 ADH2YMR303C 1047 nt10.63□□□□□ -0.71
YAR028WP39548 CWP1YKL096W 720 nt10.62□□□□□ -0.71
YAR028WP39548 BIO4YNR057C 714 nt10.62□□□□□ -0.71
YAR028WP39548 SNF6YHL025W 999 nt10.61□□□□□ -0.71
YAR028WP39548 DSK2YMR276W 1122 nt10.61□□□□□ -0.71
YAR028WP39548 PUS2YGL063W 1113 nt10.6□□□□□ -0.71
YAR028WP39548 SWE1YJL187C 2460 nt10.58□□□□□ -0.72
YAR028WP39548 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.57□□□□□ -0.72
YAR028WP39548 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.57□□□□□ -0.72
YAR028WP39548 SOR2YDL246C 1074 nt10.57□□□□□ -0.72
YAR028WP39548 YDR433WYDR433W 441 nt10.57□□□□□ -0.72
YAR028WP39548 SOR1YJR159W 1074 nt10.57□□□□□ -0.72
YAR028WP39548 BOR1YNL275W 1731 nt10.55□□□□□ -0.72
YAR028WP39548 MXR2YCL033C 507 nt10.55□□□□□ -0.72
YAR028WP39548 FMP45YDL222C 930 nt10.54□□□□□ -0.72
YAR028WP39548 CSM2YIL132C 642 nt10.52□□□□□ -0.73
YAR028WP39548 YPR011CYPR011C 981 nt10.52□□□□□ -0.73
YAR028WP39548 ERF2YLR246W 1080 nt10.51□□□□□ -0.73
YAR028WP39548 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.5□□□□□ -0.73
YAR028WP39548 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.5□□□□□ -0.73
YAR028WP39548 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.5□□□□□ -0.73
YAR028WP39548 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.5□□□□□ -0.73
YAR028WP39548 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.5□□□□□ -0.73
YAR028WP39548 YCL042WYCL042W 360 nt10.5□□□□□ -0.73
YAR028WP39548 YIH1YCR059C 777 nt10.49□□□□□ -0.73
YAR028WP39548 CRR1YLR213C 1269 nt10.48□□□□□ -0.73
YAR028WP39548 ERV46YAL042W 1248 nt10.47□□□□□ -0.73
YAR028WP39548 YKR040CYKR040C 504 nt10.44□□□□□ -0.74
YAR028WP39548 YLL053CYLL053C 459 nt10.43□□□□□ -0.74
YAR028WP39548 LPX1YOR084W 1164 nt10.43□□□□□ -0.74
YAR028WP39548 RNQ1YCL028W 1218 nt10.43□□□□□ -0.74
YAR028WP39548 FRD1YEL047C 1413 nt10.42□□□□□ -0.74
YAR028WP39548 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.41□□□□□ -0.74
YAR028WP39548 HSP60YLR259C 1719 nt10.39□□□□□ -0.75
YAR028WP39548 HEM12YDR047W 1089 nt10.37□□□□□ -0.75
YAR028WP39548 ATF2YGR177C 1608 nt10.36□□□□□ -0.75
YAR028WP39548 MIC10YCL057C-A 294 nt10.36□□□□□ -0.75
YAR028WP39548 FTR1YER145C 1215 nt10.33□□□□□ -0.76
YAR028WP39548 YFL067WYFL067W 528 nt10.33□□□□□ -0.76
YAR028WP39548 SNG1YGR197C 1644 nt10.32□□□□□ -0.76
YAR028WP39548 RAX1YOR301W 1308 nt10.32□□□□□ -0.76
YAR028WP39548 GLK1YCL040W 1503 nt10.31□□□□□ -0.76
YAR028WP39548 DIC1YLR348C 897 nt10.29□□□□□ -0.76
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