Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 CCT6YDR188W 1641 nt11.69□□□□□ -0.54
SSZ1P38788 LSM3YLR438C-A 270 nt11.64□□□□□ -0.55
SSZ1P38788 GIS3YLR094C 1509 nt11.64□□□□□ -0.55
SSZ1P38788 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.62□□□□□ -0.55
SSZ1P38788 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.62□□□□□ -0.55
SSZ1P38788 PIB2YGL023C 1908 nt11.59□□□□□ -0.55
SSZ1P38788 WWM1YFL010C 636 nt11.55□□□□□ -0.56
SSZ1P38788 GFD2YCL036W 1701 nt11.55□□□□□ -0.56
SSZ1P38788 YSC84YHR016C 1407 nt11.53□□□□□ -0.56
SSZ1P38788 ART5YGR068C 1761 nt11.51□□□□□ -0.57
SSZ1P38788 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.48□□□□□ -0.57
SSZ1P38788 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.48□□□□□ -0.57
SSZ1P38788 YHL050CYHL050C 2094 nt11.48□□□□□ -0.57
SSZ1P38788 PST2YDR032C 597 nt11.47□□□□□ -0.57
SSZ1P38788 PET9YBL030C 957 nt11.47□□□□□ -0.57
SSZ1P38788 RTF1YGL244W 1677 nt11.44□□□□□ -0.58
SSZ1P38788 RTS2YOR077W 699 nt11.43□□□□□ -0.58
SSZ1P38788 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.42□□□□□ -0.58
SSZ1P38788 CUE1YMR264W 612 nt11.4□□□□□ -0.58
SSZ1P38788 YCH1YGR203W 447 nt11.39□□□□□ -0.59
SSZ1P38788 YGR021WYGR021W 873 nt11.36□□□□□ -0.59
SSZ1P38788 BOP3YNL042W 1191 nt11.35□□□□□ -0.59
SSZ1P38788 RRT12YCR045C 1476 nt11.35□□□□□ -0.59
SSZ1P38788 YNL195CYNL195C 786 nt11.3□□□□□ -0.6
SSZ1P38788 PTK1YKL198C 1989 nt11.28□□□□□ -0.6
SSZ1P38788 TIR4YOR009W 1464 nt11.27□□□□□ -0.6
SSZ1P38788 HOM6YJR139C 1080 nt11.27□□□□□ -0.61
SSZ1P38788 YIL100WYIL100W 354 nt11.24□□□□□ -0.61
SSZ1P38788 BOR1YNL275W 1731 nt11.19□□□□□ -0.62
SSZ1P38788 YMR057CYMR057C 372 nt11.19□□□□□ -0.62
SSZ1P38788 MCH5YOR306C 1566 nt11.17□□□□□ -0.62
SSZ1P38788 NCP1YHR042W 2076 nt11.16□□□□□ -0.62
SSZ1P38788 YLR236CYLR236C 324 nt11.14□□□□□ -0.63
SSZ1P38788 SHU1YHL006C 453 nt11.11□□□□□ -0.63
SSZ1P38788 RKM5YLR137W 1104 nt11.09□□□□□ -0.63
SSZ1P38788 MNP1YGL068W 585 nt11.07□□□□□ -0.64
SSZ1P38788 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.07□□□□□ -0.64
SSZ1P38788 NPL3YDR432W 1245 nt11.03□□□□□ -0.64
SSZ1P38788 YFL054CYFL054C 1941 nt11□□□□□ -0.65
SSZ1P38788 SPT8YLR055C 1809 nt10.98□□□□□ -0.65
SSZ1P38788 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.94□□□□□ -0.66
SSZ1P38788 LCB1YMR296C 1677 nt10.92□□□□□ -0.66
SSZ1P38788 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.91□□□□□ -0.66
SSZ1P38788 YJL152WYJL152W 360 nt10.9□□□□□ -0.66
SSZ1P38788 ALG12YNR030W 1656 nt10.8□□□□□ -0.68
SSZ1P38788 SWE1YJL187C 2460 nt10.76□□□□□ -0.69
SSZ1P38788 HSP60YLR259C 1719 nt10.74□□□□□ -0.69
SSZ1P38788 FMP52YER004W 696 nt10.73□□□□□ -0.69
SSZ1P38788 LYS4YDR234W 2082 nt10.72□□□□□ -0.69
SSZ1P38788 YOL037CYOL037C 354 nt10.72□□□□□ -0.69
SSZ1P38788 RRD1YIL153W 1182 nt10.71□□□□□ -0.69
SSZ1P38788 RPM1RPM1 483 nt10.7□□□□□ -0.7
SSZ1P38788 SIM1YIL123W 1431 nt10.68□□□□□ -0.7
SSZ1P38788 YKL097CYKL097C 411 nt10.66□□□□□ -0.7
SSZ1P38788 PCM1YEL058W 1674 nt10.66□□□□□ -0.7
SSZ1P38788 DED1YOR204W 1815 nt10.58□□□□□ -0.72
SSZ1P38788 IDH1YNL037C 1083 nt10.57□□□□□ -0.72
SSZ1P38788 BIO4YNR057C 714 nt10.57□□□□□ -0.72
SSZ1P38788 GLK1YCL040W 1503 nt10.56□□□□□ -0.72
SSZ1P38788 WHI5YOR083W 888 nt10.55□□□□□ -0.72
SSZ1P38788 GBP2YCL011C 1284 nt10.55□□□□□ -0.72
SSZ1P38788 FMT1YBL013W 1206 nt10.54□□□□□ -0.72
SSZ1P38788 TCD2YKL027W 1344 nt10.54□□□□□ -0.72
SSZ1P38788 SNF6YHL025W 999 nt10.51□□□□□ -0.73
SSZ1P38788 ERF2YLR246W 1080 nt10.5□□□□□ -0.73
SSZ1P38788 YLR281CYLR281C 468 nt10.5□□□□□ -0.73
SSZ1P38788 ADH2YMR303C 1047 nt10.49□□□□□ -0.73
SSZ1P38788 CRR1YLR213C 1269 nt10.48□□□□□ -0.73
SSZ1P38788 FUR4YBR021W 1902 nt10.46□□□□□ -0.73
SSZ1P38788 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.46□□□□□ -0.73
SSZ1P38788 CWP1YKL096W 720 nt10.46□□□□□ -0.73
SSZ1P38788 HSL7YBR133C 2484 nt10.46□□□□□ -0.74
SSZ1P38788 NAR1YNL240C 1476 nt10.42□□□□□ -0.74
SSZ1P38788 YIH1YCR059C 777 nt10.4□□□□□ -0.74
SSZ1P38788 SOR2YDL246C 1074 nt10.4□□□□□ -0.74
SSZ1P38788 SOR1YJR159W 1074 nt10.4□□□□□ -0.74
SSZ1P38788 IMP2'YIL154C 1041 nt10.38□□□□□ -0.75
SSZ1P38788 DSK2YMR276W 1122 nt10.37□□□□□ -0.75
SSZ1P38788 CCA1YER168C 1641 nt10.36□□□□□ -0.75
SSZ1P38788 RAX1YOR301W 1308 nt10.35□□□□□ -0.75
SSZ1P38788 HEM12YDR047W 1089 nt10.35□□□□□ -0.75
SSZ1P38788 YOR139CYOR139C 393 nt10.35□□□□□ -0.75
SSZ1P38788 PRP4YPR178W 1398 nt10.35□□□□□ -0.75
SSZ1P38788 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.34□□□□□ -0.75
SSZ1P38788 YEL076CYEL076C 651 nt10.34□□□□□ -0.75
SSZ1P38788 YLR464WYLR464W 651 nt10.34□□□□□ -0.75
SSZ1P38788 YLL053CYLL053C 459 nt10.33□□□□□ -0.76
SSZ1P38788 RNQ1YCL028W 1218 nt10.33□□□□□ -0.76
SSZ1P38788 MIC10YCL057C-A 294 nt10.33□□□□□ -0.76
SSZ1P38788 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.32□□□□□ -0.76
SSZ1P38788 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.32□□□□□ -0.76
SSZ1P38788 AAC1YMR056C 930 nt10.32□□□□□ -0.76
SSZ1P38788 ATF2YGR177C 1608 nt10.3□□□□□ -0.76
SSZ1P38788 YCL042WYCL042W 360 nt10.3□□□□□ -0.76
SSZ1P38788 DPS1YLL018C 1674 nt10.29□□□□□ -0.76
SSZ1P38788 SNG1YGR197C 1644 nt10.29□□□□□ -0.76
SSZ1P38788 CMP2YML057W 1815 nt10.28□□□□□ -0.76
SSZ1P38788 YFL067WYFL067W 528 nt10.28□□□□□ -0.76
SSZ1P38788 HEL2YDR266C 1920 nt10.27□□□□□ -0.77
SSZ1P38788 YDR433WYDR433W 441 nt10.26□□□□□ -0.77
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