Protein–RNA interactions for Protein: P38750

YHL008C, Uncharacterized transporter YHL008C, yeastyeast

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL008CP38750 LSM3YLR438C-A 270 nt12.36□□□□□ -0.43
YHL008CP38750 SIS1YNL007C 1059 nt12.34□□□□□ -0.43
YHL008CP38750 IRC15YPL017C 1500 nt12.33□□□□□ -0.44
YHL008CP38750 SCC4YER147C 1875 nt12.3□□□□□ -0.44
YHL008CP38750 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.26□□□□□ -0.45
YHL008CP38750 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.26□□□□□ -0.45
YHL008CP38750 YOL037CYOL037C 354 nt12.26□□□□□ -0.45
YHL008CP38750 GIS3YLR094C 1509 nt12.25□□□□□ -0.45
YHL008CP38750 NME1NME1 340 nt12.24□□□□□ -0.45
YHL008CP38750 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.23□□□□□ -0.45
YHL008CP38750 RKM5YLR137W 1104 nt12.22□□□□□ -0.45
YHL008CP38750 PCH2YBR186W 1695 nt12.22□□□□□ -0.45
YHL008CP38750 GFD2YCL036W 1701 nt12.2□□□□□ -0.46
YHL008CP38750 ART5YGR068C 1761 nt12.19□□□□□ -0.46
YHL008CP38750 GUT2YIL155C 1950 nt12.18□□□□□ -0.46
YHL008CP38750 SEC11YIR022W 504 nt12.18□□□□□ -0.46
YHL008CP38750 PAC11YDR488C 1602 nt12.13□□□□□ -0.47
YHL008CP38750 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.12□□□□□ -0.47
YHL008CP38750 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.12□□□□□ -0.47
YHL008CP38750 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.12□□□□□ -0.47
YHL008CP38750 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.12□□□□□ -0.47
YHL008CP38750 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.12□□□□□ -0.47
YHL008CP38750 RTS2YOR077W 699 nt12.11□□□□□ -0.47
YHL008CP38750 PET9YBL030C 957 nt12.09□□□□□ -0.47
YHL008CP38750 YSC84YHR016C 1407 nt12.07□□□□□ -0.48
YHL008CP38750 PIB2YGL023C 1908 nt12.03□□□□□ -0.48
YHL008CP38750 YHL050CYHL050C 2094 nt12.02□□□□□ -0.49
YHL008CP38750 CUE1YMR264W 612 nt12□□□□□ -0.49
YHL008CP38750 TIR4YOR009W 1464 nt12□□□□□ -0.49
YHL008CP38750 YCH1YGR203W 447 nt11.98□□□□□ -0.49
YHL008CP38750 YLR281CYLR281C 468 nt11.98□□□□□ -0.49
YHL008CP38750 RRT12YCR045C 1476 nt11.94□□□□□ -0.5
YHL008CP38750 PUS2YGL063W 1113 nt11.91□□□□□ -0.5
YHL008CP38750 YGR139WYGR139W 339 nt11.9□□□□□ -0.5
YHL008CP38750 YMR057CYMR057C 372 nt11.9□□□□□ -0.5
YHL008CP38750 WHI5YOR083W 888 nt11.89□□□□□ -0.51
YHL008CP38750 RTF1YGL244W 1677 nt11.88□□□□□ -0.51
YHL008CP38750 FPS1YLL043W 2010 nt11.86□□□□□ -0.51
YHL008CP38750 YIL100WYIL100W 354 nt11.81□□□□□ -0.52
YHL008CP38750 YNL195CYNL195C 786 nt11.81□□□□□ -0.52
YHL008CP38750 NVJ2YPR091C 2313 nt11.8□□□□□ -0.52
YHL008CP38750 BOP3YNL042W 1191 nt11.78□□□□□ -0.52
YHL008CP38750 PTK1YKL198C 1989 nt11.74□□□□□ -0.53
YHL008CP38750 YLR236CYLR236C 324 nt11.74□□□□□ -0.53
YHL008CP38750 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.7□□□□□ -0.54
YHL008CP38750 NCP1YHR042W 2076 nt11.68□□□□□ -0.54
YHL008CP38750 YPR011CYPR011C 981 nt11.68□□□□□ -0.54
YHL008CP38750 YJL152WYJL152W 360 nt11.66□□□□□ -0.54
YHL008CP38750 DSK2YMR276W 1122 nt11.66□□□□□ -0.54
YHL008CP38750 IMP2'YIL154C 1041 nt11.64□□□□□ -0.55
YHL008CP38750 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.62□□□□□ -0.55
YHL008CP38750 FMP45YDL222C 930 nt11.59□□□□□ -0.55
YHL008CP38750 LCB1YMR296C 1677 nt11.5□□□□□ -0.57
YHL008CP38750 YFL054CYFL054C 1941 nt11.45□□□□□ -0.58
YHL008CP38750 RRD1YIL153W 1182 nt11.43□□□□□ -0.58
YHL008CP38750 ERV46YAL042W 1248 nt11.42□□□□□ -0.58
YHL008CP38750 SPT8YLR055C 1809 nt11.42□□□□□ -0.58
YHL008CP38750 LPX1YOR084W 1164 nt11.4□□□□□ -0.58
YHL008CP38750 IDH1YNL037C 1083 nt11.39□□□□□ -0.59
YHL008CP38750 MRPL8YJL063C 717 nt11.37□□□□□ -0.59
YHL008CP38750 FMP52YER004W 696 nt11.34□□□□□ -0.59
YHL008CP38750 YJL225CYJL225C 5277 nt11.34□□□□□ -0.59
YHL008CP38750 DED1YOR204W 1815 nt11.33□□□□□ -0.6
YHL008CP38750 GBP2YCL011C 1284 nt11.31□□□□□ -0.6
YHL008CP38750 PCM1YEL058W 1674 nt11.3□□□□□ -0.6
YHL008CP38750 SPP1YPL138C 1062 nt11.29□□□□□ -0.6
YHL008CP38750 LYS4YDR234W 2082 nt11.29□□□□□ -0.6
YHL008CP38750 SIM1YIL123W 1431 nt11.28□□□□□ -0.6
YHL008CP38750 YDR433WYDR433W 441 nt11.28□□□□□ -0.6
YHL008CP38750 YKR040CYKR040C 504 nt11.28□□□□□ -0.6
YHL008CP38750 FMT1YBL013W 1206 nt11.27□□□□□ -0.61
YHL008CP38750 TCD2YKL027W 1344 nt11.25□□□□□ -0.61
YHL008CP38750 RTG1YOL067C 534 nt11.22□□□□□ -0.61
YHL008CP38750 SWE1YJL187C 2460 nt11.21□□□□□ -0.61
YHL008CP38750 BOR1YNL275W 1731 nt11.21□□□□□ -0.62
YHL008CP38750 MXR2YCL033C 507 nt11.2□□□□□ -0.62
YHL008CP38750 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.19□□□□□ -0.62
YHL008CP38750 YEL076CYEL076C 651 nt11.19□□□□□ -0.62
YHL008CP38750 ADO1YJR105W 1023 nt11.19□□□□□ -0.62
YHL008CP38750 YLR464WYLR464W 651 nt11.19□□□□□ -0.62
YHL008CP38750 ADH2YMR303C 1047 nt11.19□□□□□ -0.62
YHL008CP38750 BIO4YNR057C 714 nt11.19□□□□□ -0.62
YHL008CP38750 CWP1YKL096W 720 nt11.16□□□□□ -0.62
YHL008CP38750 SNF6YHL025W 999 nt11.14□□□□□ -0.63
YHL008CP38750 CSM2YIL132C 642 nt11.12□□□□□ -0.63
YHL008CP38750 SOR2YDL246C 1074 nt11.09□□□□□ -0.63
YHL008CP38750 SOR1YJR159W 1074 nt11.09□□□□□ -0.63
YHL008CP38750 CRR1YLR213C 1269 nt11.05□□□□□ -0.64
YHL008CP38750 HSP60YLR259C 1719 nt11.04□□□□□ -0.64
YHL008CP38750 ERF2YLR246W 1080 nt11.04□□□□□ -0.64
YHL008CP38750 UME6YDR207C 2511 nt11.03□□□□□ -0.64
YHL008CP38750 FRD1YEL047C 1413 nt11.03□□□□□ -0.64
YHL008CP38750 YIH1YCR059C 777 nt11.03□□□□□ -0.64
YHL008CP38750 UBX6YJL048C 1191 nt11□□□□□ -0.65
YHL008CP38750 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.99□□□□□ -0.65
YHL008CP38750 YCL042WYCL042W 360 nt10.99□□□□□ -0.65
YHL008CP38750 YLL053CYLL053C 459 nt10.98□□□□□ -0.65
YHL008CP38750 RNQ1YCL028W 1218 nt10.96□□□□□ -0.65
YHL008CP38750 HUA1YGR268C 597 nt10.94□□□□□ -0.66
YHL008CP38750 MIC10YCL057C-A 294 nt10.94□□□□□ -0.66
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