Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 RPL22-202ENST00000462296 600 ntTSL 39.28□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 99.5
GTF2F1P35269 RPL22-205ENST00000471204 524 ntTSL 25.28□□□□□ -1.563e-7■■■■■ 99.5
GTF2F1P35269 TNK2-210ENST00000433111 580 ntTSL 424.8■■□□□ 1.563e-24■■■■■ 97.4
GTF2F1P35269 GABBR1-207ENST00000467259 1252 ntTSL 226.75■■□□□ 1.873e-12■■■■■ 97.1
GTF2F1P35269 GABBR1-206ENST00000462632 609 ntTSL 416.51■□□□□ 0.233e-12■■■■■ 97.1
GTF2F1P35269 EHMT1-219ENST00000626066 1297 ntTSL 518.63■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 96.3
GTF2F1P35269 EHMT1-250ENST00000637977 2167 ntTSL 518.31■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 96.3
GTF2F1P35269 EHMT1-222ENST00000629417 882 ntTSL 312.74□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 96.3
GTF2F1P35269 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 320.31■□□□□ 0.844e-11■■■■■ 93.9
GTF2F1P35269 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 318.53■□□□□ 0.564e-11■■■■■ 93.9
GTF2F1P35269 CTNNB1-209ENST00000450969 645 ntTSL 46.94□□□□□ -1.34e-24■■■■■ 91.1
GTF2F1P35269 VEGFA-214ENST00000493786 551 ntTSL 28.06□□□□□ -1.124e-25■■■■■ 91
GTF2F1P35269 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.69■■□□□ 1.061e-12■■■■■ 90.4
GTF2F1P35269 NPIPA1-203ENST00000472413 5345 ntTSL 217.53■□□□□ 0.41e-12■■■■■ 90.4
GTF2F1P35269 NPIPA1-206ENST00000541836 2747 ntTSL 516.57■□□□□ 0.241e-12■■■■■ 90.4
GTF2F1P35269 SURF1-202ENST00000437995 813 ntTSL 521.44■■□□□ 1.022e-58■■■■■ 90.2
GTF2F1P35269 MED22-203ENST00000446777 560 ntTSL 526.99■■□□□ 1.913e-15■■■■■ 89.8
GTF2F1P35269 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.693e-15■■■■■ 89.8
GTF2F1P35269 MED22-205ENST00000471524 879 ntTSL 322.03■■□□□ 1.123e-15■■■■■ 89.8
GTF2F1P35269 MED22-207ENST00000494177 532 ntTSL 421.27■■□□□ 13e-15■■■■■ 89.8
GTF2F1P35269 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.723e-15■■■■■ 89.8
GTF2F1P35269 MED22-206ENST00000482295 491 ntTSL 319.12■□□□□ 0.653e-15■■■■■ 89.8
GTF2F1P35269 MED22-204ENST00000457204 561 ntTSL 418.29■□□□□ 0.523e-15■■■■■ 89.8
GTF2F1P35269 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.243e-15■■■■■ 89.8
GTF2F1P35269 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.942e-9■■■■■ 89.1
GTF2F1P35269 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.592e-9■■■■■ 89.1
GTF2F1P35269 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.482e-9■■■■■ 89.1
GTF2F1P35269 KCTD15-209ENST00000590771 577 ntTSL 317.8■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 89.1
GTF2F1P35269 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.134e-11■■■■■ 88.5
GTF2F1P35269 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 220.69■□□□□ 0.94e-11■■■■■ 88.5
GTF2F1P35269 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.224e-11■■■■■ 88.5
GTF2F1P35269 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 216.21■□□□□ 0.194e-11■■■■■ 88.5
GTF2F1P35269 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.064e-11■■■■■ 88.5
GTF2F1P35269 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.724e-8■■■■■ 86.9
GTF2F1P35269 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.84e-30■■■■■ 86.8
GTF2F1P35269 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.934e-30■■■■■ 86.8
GTF2F1P35269 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.124e-30■■■■■ 86.8
GTF2F1P35269 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.875e-8■■■■■ 86.6
GTF2F1P35269 LONP2-201ENST00000285737 8199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.581e-16■■■■■ 86
GTF2F1P35269 LONP2-206ENST00000565867 1969 ntTSL 310.34□□□□□ -0.751e-16■■■■■ 86
GTF2F1P35269 LONP2-204ENST00000564259 819 ntTSL 36.4□□□□□ -1.381e-16■■■■■ 86
GTF2F1P35269 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.381e-8■■■■■ 85.3
GTF2F1P35269 WWP1-210ENST00000523863 796 ntTSL 322.31■■□□□ 1.168e-13■■■■■ 85.2
GTF2F1P35269 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.868e-13■■■■■ 85.2
GTF2F1P35269 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.682e-22■■■■■ 85.1
GTF2F1P35269 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-17■■■■■ 83.9
GTF2F1P35269 BST2-203ENST00000533098 459 ntTSL 210.65□□□□□ -0.72e-17■■■■■ 83.9
GTF2F1P35269 MGRN1-213ENST00000590790 994 ntTSL 516.3■□□□□ 0.24e-9■■■■■ 83.9
GTF2F1P35269 MGRN1-209ENST00000588015 651 ntTSL 513.13□□□□□ -0.314e-9■■■■■ 83.9
GTF2F1P35269 MGRN1-212ENST00000590457 552 ntTSL 312.22□□□□□ -0.454e-9■■■■■ 83.9
GTF2F1P35269 MGRN1-207ENST00000587145 577 ntTSL 412.22□□□□□ -0.454e-9■■■■■ 83.9
GTF2F1P35269 MGRN1-217ENST00000593224 498 ntTSL 511.71□□□□□ -0.534e-9■■■■■ 83.9
GTF2F1P35269 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.574e-22■■■■■ 83.6
GTF2F1P35269 CORO1C-215ENST00000551044 567 ntTSL 38.37□□□□□ -1.071e-21■■■■■ 83.5
GTF2F1P35269 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 83
GTF2F1P35269 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 83
GTF2F1P35269 CSNK1D-218ENST00000581655 549 ntTSL 414.79□□□□□ -0.041e-10■■■■■ 82.8
GTF2F1P35269 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.17e-8■■■■■ 82.3
GTF2F1P35269 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.317e-8■■■■■ 82.3
GTF2F1P35269 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 81.7
GTF2F1P35269 UBAP1-205ENST00000626262 1753 ntTSL 222.45■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 81.7
GTF2F1P35269 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 81.7
GTF2F1P35269 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 81.7
GTF2F1P35269 KCTD15-205ENST00000588637 571 ntTSL 519.51■□□□□ 0.711e-9■■■■■ 81.4
GTF2F1P35269 BLVRB-203ENST00000597870 1392 ntTSL 520.15■□□□□ 0.828e-23■■■■■ 81.3
GTF2F1P35269 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.358e-23■■■■■ 81.3
GTF2F1P35269 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.168e-23■■■■■ 81.3
GTF2F1P35269 FDXR-215ENST00000581969 568 ntTSL 421.71■■□□□ 1.074e-20■■■■■ 81.2
GTF2F1P35269 FDXR-211ENST00000579893 558 ntTSL 420■□□□□ 0.794e-20■■■■■ 81.2
GTF2F1P35269 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.724e-20■■■■■ 81.2
GTF2F1P35269 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.882e-18■■■■■ 80.7
GTF2F1P35269 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-18■■■■■ 80.7
GTF2F1P35269 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.022e-18■■■■■ 80.7
GTF2F1P35269 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-18■■■■■ 80.7
GTF2F1P35269 CTNNB1-206ENST00000431914 634 ntTSL 412.68□□□□□ -0.382e-18■■■■■ 80.7
GTF2F1P35269 CTNNB1-204ENST00000405570 2513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.452e-18■■■■■ 80.7
GTF2F1P35269 CTNNB1-207ENST00000433400 596 ntTSL 48.6□□□□□ -1.032e-18■■■■■ 80.7
GTF2F1P35269 CTNNB1-205ENST00000426215 563 ntTSL 46.16□□□□□ -1.422e-18■■■■■ 80.7
GTF2F1P35269 POLR2H-207ENST00000455712 823 ntTSL 314.11□□□□□ -0.153e-15■■■■■ 80.7
GTF2F1P35269 RNASET2-209ENST00000499370 2164 ntTSL 213.21□□□□□ -0.31e-11■■■■■ 80.2
GTF2F1P35269 RNASET2-208ENST00000496851 881 ntTSL 510.49□□□□□ -0.731e-11■■■■■ 80.2
GTF2F1P35269 CORO1C-216ENST00000551059 474 ntTSL 220.52■□□□□ 0.881e-10■■■■■ 79.8
GTF2F1P35269 CORO1C-219ENST00000552871 587 ntTSL 320.35■□□□□ 0.851e-10■■■■■ 79.8
GTF2F1P35269 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.522e-28■■■■■ 79.1
GTF2F1P35269 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.992e-28■■■■■ 79.1
GTF2F1P35269 NPM1-208ENST00000521672 597 ntTSL 58.71□□□□□ -1.022e-28■■■■■ 79.1
GTF2F1P35269 NPM1-211ENST00000523622 247 ntTSL 37.96□□□□□ -1.142e-28■■■■■ 79.1
GTF2F1P35269 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.272e-28■■■■■ 79.1
GTF2F1P35269 NPM1-205ENST00000518587 670 ntTSL 27.11□□□□□ -1.272e-28■■■■■ 79.1
GTF2F1P35269 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.292e-28■■■■■ 79.1
GTF2F1P35269 NPM1-210ENST00000523339 268 ntTSL 24.51□□□□□ -1.692e-28■■■■■ 79.1
GTF2F1P35269 PTPRVP-203ENST00000638692 1189 ntTSL 1 (best)19■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 78.8
GTF2F1P35269 CORO1C-217ENST00000551550 547 ntTSL 410.36□□□□□ -0.752e-10■■■■■ 78.5
GTF2F1P35269 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.113e-75■■■■■ 78
GTF2F1P35269 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.922e-19■■■■■ 78
GTF2F1P35269 C19orf12-203ENST00000392275 1188 ntTSL 226.58■■□□□ 1.852e-19■■■■■ 78
GTF2F1P35269 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.512e-19■■■■■ 78
GTF2F1P35269 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.512e-19■■■■■ 78
GTF2F1P35269 SPATS2-209ENST00000548777 505 ntTSL 324.18■■□□□ 1.462e-19■■■■■ 78
GTF2F1P35269 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.32e-19■■■■■ 78
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 43.5 ms