Protein–RNA interactions for Protein: P34167

TIF3, Eukaryotic translation initiation factor 4B, yeast

Known RBP Predictions only

Length 436 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIF3	P34167	YSC84	YHR016C	1407 nt		11.76	□□□□□ -0.53
TIF3	P34167	CCT6	YDR188W	1641 nt		11.74	□□□□□ -0.53
TIF3	P34167	GFD2	YCL036W	1701 nt		11.7	□□□□□ -0.54
TIF3	P34167	YHL050C	YHL050C	2094 nt		11.69	□□□□□ -0.54
TIF3	P34167	ART5	YGR068C	1761 nt		11.67	□□□□□ -0.54
TIF3	P34167	RTS2	YOR077W	699 nt		11.66	□□□□□ -0.54
TIF3	P34167	SUF2	tP(AGG)C	72 nt		11.65	□□□□□ -0.54
TIF3	P34167	SUF10	tP(AGG)N	72 nt		11.65	□□□□□ -0.54
TIF3	P34167	RTF1	YGL244W	1677 nt		11.65	□□□□□ -0.55
TIF3	P34167	LSM3	YLR438C-A	270 nt		11.63	□□□□□ -0.55
TIF3	P34167	WWM1	YFL010C	636 nt		11.61	□□□□□ -0.55
TIF3	P34167	RRT12	YCR045C	1476 nt		11.58	□□□□□ -0.56
TIF3	P34167	BOR1	YNL275W	1731 nt		11.55	□□□□□ -0.56
TIF3	P34167	PST2	YDR032C	597 nt		11.54	□□□□□ -0.56
TIF3	P34167	PET9	YBL030C	957 nt		11.54	□□□□□ -0.56
TIF3	P34167	CUE1	YMR264W	612 nt		11.52	□□□□□ -0.57
TIF3	P34167	BOP3	YNL042W	1191 nt		11.51	□□□□□ -0.57
TIF3	P34167	PTK1	YKL198C	1989 nt		11.5	□□□□□ -0.57
TIF3	P34167	MOT3	YMR070W	1473 nt		11.49	□□□□□ -0.57
TIF3	P34167	MCH5	YOR306C	1566 nt		11.45	□□□□□ -0.58
TIF3	P34167	YNL195C	YNL195C	786 nt		11.43	□□□□□ -0.58
TIF3	P34167	YFL021C-A	YFL021C-A	855 nt		11.42	□□□□□ -0.58
TIF3	P34167	YCH1	YGR203W	447 nt		11.41	□□□□□ -0.58
TIF3	P34167	TIR4	YOR009W	1464 nt		11.4	□□□□□ -0.58
TIF3	P34167	YJL225C	YJL225C	5277 nt		11.39	□□□□□ -0.59
TIF3	P34167	YIL100W	YIL100W	354 nt		11.36	□□□□□ -0.59
TIF3	P34167	YMR057C	YMR057C	372 nt		11.34	□□□□□ -0.59
TIF3	P34167	NCP1	YHR042W	2076 nt		11.33	□□□□□ -0.6
TIF3	P34167	YGR021W	YGR021W	873 nt		11.31	□□□□□ -0.6
TIF3	P34167	HOM6	YJR139C	1080 nt		11.27	□□□□□ -0.61
TIF3	P34167	YFL054C	YFL054C	1941 nt		11.23	□□□□□ -0.61
TIF3	P34167	YLR236C	YLR236C	324 nt		11.23	□□□□□ -0.61
TIF3	P34167	SPT8	YLR055C	1809 nt		11.18	□□□□□ -0.62
TIF3	P34167	YAL037C-B	YAL037C-B	975 nt		11.13	□□□□□ -0.63
TIF3	P34167	ALG12	YNR030W	1656 nt		11.12	□□□□□ -0.63
TIF3	P34167	MNP1	YGL068W	585 nt		11.12	□□□□□ -0.63
TIF3	P34167	RKM5	YLR137W	1104 nt		11.1	□□□□□ -0.63
TIF3	P34167	LCB1	YMR296C	1677 nt		11.1	□□□□□ -0.63
TIF3	P34167	SHU1	YHL006C	453 nt		11.08	□□□□□ -0.64
TIF3	P34167	NPL3	YDR432W	1245 nt		11.07	□□□□□ -0.64
TIF3	P34167	YKL097C	YKL097C	411 nt		11.04	□□□□□ -0.64
TIF3	P34167	YCL048W-A	YCL048W-A	240 nt		11.01	□□□□□ -0.65
TIF3	P34167	YJL152W	YJL152W	360 nt		10.99	□□□□□ -0.65
TIF3	P34167	RDN37-1	RDN37-1	5354 nt		10.99	□□□□□ -0.65
TIF3	P34167	RDN37-2	RDN37-2	5354 nt		10.99	□□□□□ -0.65
TIF3	P34167	SWE1	YJL187C	2460 nt		10.96	□□□□□ -0.65
TIF3	P34167	YLR154C-G	YLR154C-G	150 nt		10.94	□□□□□ -0.66
TIF3	P34167	HSP60	YLR259C	1719 nt		10.92	□□□□□ -0.66
TIF3	P34167	LYS4	YDR234W	2082 nt		10.88	□□□□□ -0.67
TIF3	P34167	RPM1	RPM1	483 nt		10.85	□□□□□ -0.67
TIF3	P34167	SIM1	YIL123W	1431 nt		10.82	□□□□□ -0.68
TIF3	P34167	RRD1	YIL153W	1182 nt		10.8	□□□□□ -0.68
TIF3	P34167	GLK1	YCL040W	1503 nt		10.78	□□□□□ -0.68
TIF3	P34167	PCM1	YEL058W	1674 nt		10.76	□□□□□ -0.69
TIF3	P34167	NAR1	YNL240C	1476 nt		10.75	□□□□□ -0.69
TIF3	P34167	FMP52	YER004W	696 nt		10.74	□□□□□ -0.69
TIF3	P34167	BIO4	YNR057C	714 nt		10.7	□□□□□ -0.7
TIF3	P34167	YOR139C	YOR139C	393 nt		10.68	□□□□□ -0.7
TIF3	P34167	FUR4	YBR021W	1902 nt		10.68	□□□□□ -0.7
TIF3	P34167	DED1	YOR204W	1815 nt		10.68	□□□□□ -0.7
TIF3	P34167	FMT1	YBL013W	1206 nt		10.65	□□□□□ -0.7
TIF3	P34167	HSL7	YBR133C	2484 nt		10.64	□□□□□ -0.71
TIF3	P34167	YOL037C	YOL037C	354 nt		10.63	□□□□□ -0.71
TIF3	P34167	ADH2	YMR303C	1047 nt		10.61	□□□□□ -0.71
TIF3	P34167	GBP2	YCL011C	1284 nt		10.61	□□□□□ -0.71
TIF3	P34167	CMP2	YML057W	1815 nt		10.6	□□□□□ -0.71
TIF3	P34167	YHR056W-A	YHR056W-A	435 nt		10.59	□□□□□ -0.71
TIF3	P34167	SNF6	YHL025W	999 nt		10.58	□□□□□ -0.72
TIF3	P34167	CWP1	YKL096W	720 nt		10.58	□□□□□ -0.72
TIF3	P34167	CRR1	YLR213C	1269 nt		10.58	□□□□□ -0.72
TIF3	P34167	IDH1	YNL037C	1083 nt		10.58	□□□□□ -0.72
TIF3	P34167	TCD2	YKL027W	1344 nt		10.58	□□□□□ -0.72
TIF3	P34167	ERF2	YLR246W	1080 nt		10.57	□□□□□ -0.72
TIF3	P34167	DSK2	YMR276W	1122 nt		10.56	□□□□□ -0.72
TIF3	P34167	PRP4	YPR178W	1398 nt		10.55	□□□□□ -0.72
TIF3	P34167	CCA1	YER168C	1641 nt		10.55	□□□□□ -0.72
TIF3	P34167	WHI5	YOR083W	888 nt		10.53	□□□□□ -0.72
TIF3	P34167	YEL076C-A	YEL076C-A	651 nt		10.52	□□□□□ -0.73
TIF3	P34167	YEL076C	YEL076C	651 nt		10.52	□□□□□ -0.73
TIF3	P34167	YLR464W	YLR464W	651 nt		10.52	□□□□□ -0.73
TIF3	P34167	AAC1	YMR056C	930 nt		10.51	□□□□□ -0.73
TIF3	P34167	HEL2	YDR266C	1920 nt		10.5	□□□□□ -0.73
TIF3	P34167	MIC10	YCL057C-A	294 nt		10.49	□□□□□ -0.73
TIF3	P34167	DPS1	YLL018C	1674 nt		10.49	□□□□□ -0.73
TIF3	P34167	RAX1	YOR301W	1308 nt		10.47	□□□□□ -0.73
TIF3	P34167	HEM12	YDR047W	1089 nt		10.46	□□□□□ -0.73
TIF3	P34167	YLR281C	YLR281C	468 nt		10.46	□□□□□ -0.73
TIF3	P34167	RDN25-1	RDN25-1	3396 nt		10.46	□□□□□ -0.74
TIF3	P34167	RDN25-2	RDN25-2	3396 nt		10.46	□□□□□ -0.74
TIF3	P34167	YIH1	YCR059C	777 nt		10.45	□□□□□ -0.74
TIF3	P34167	YLL053C	YLL053C	459 nt		10.43	□□□□□ -0.74
TIF3	P34167	ATF2	YGR177C	1608 nt		10.43	□□□□□ -0.74
TIF3	P34167	SOR2	YDL246C	1074 nt		10.41	□□□□□ -0.74
TIF3	P34167	SOR1	YJR159W	1074 nt		10.41	□□□□□ -0.74
TIF3	P34167	BIO5	YNR056C	1686 nt		10.41	□□□□□ -0.74
TIF3	P34167	SNG1	YGR197C	1644 nt		10.4	□□□□□ -0.74
TIF3	P34167	SNF1	YDR477W	1902 nt		10.39	□□□□□ -0.75
TIF3	P34167	CYT2	YKL087C	675 nt		10.37	□□□□□ -0.75
TIF3	P34167	YKR005C	YKR005C	1578 nt		10.37	□□□□□ -0.75
TIF3	P34167	RNQ1	YCL028W	1218 nt		10.37	□□□□□ -0.75

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.8 ms