Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.39□□□□□ -0.43
NDI1P32340 YLR281CYLR281C 468 nt12.39□□□□□ -0.43
NDI1P32340 ART5YGR068C 1761 nt12.36□□□□□ -0.43
NDI1P32340 YDL221WYDL221W 552 nt12.36□□□□□ -0.43
NDI1P32340 YCH1YGR203W 447 nt12.36□□□□□ -0.43
NDI1P32340 WHI5YOR083W 888 nt12.36□□□□□ -0.43
NDI1P32340 PET9YBL030C 957 nt12.35□□□□□ -0.43
NDI1P32340 GFD2YCL036W 1701 nt12.34□□□□□ -0.43
NDI1P32340 TIR4YOR009W 1464 nt12.34□□□□□ -0.43
NDI1P32340 YJL152WYJL152W 360 nt12.28□□□□□ -0.44
NDI1P32340 BDF1YLR399C 2061 nt12.27□□□□□ -0.45
NDI1P32340 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.26□□□□□ -0.45
NDI1P32340 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.26□□□□□ -0.45
NDI1P32340 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.26□□□□□ -0.45
NDI1P32340 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.26□□□□□ -0.45
NDI1P32340 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.26□□□□□ -0.45
NDI1P32340 IRC15YPL017C 1500 nt12.24□□□□□ -0.45
NDI1P32340 PUS2YGL063W 1113 nt12.23□□□□□ -0.45
NDI1P32340 YBR220CYBR220C 1683 nt12.22□□□□□ -0.45
NDI1P32340 SDH1YKL148C 1923 nt12.21□□□□□ -0.45
NDI1P32340 YMR057CYMR057C 372 nt12.2□□□□□ -0.46
NDI1P32340 IMP2'YIL154C 1041 nt12.17□□□□□ -0.46
NDI1P32340 RTS2YOR077W 699 nt12.16□□□□□ -0.46
NDI1P32340 GIS3YLR094C 1509 nt12.16□□□□□ -0.46
NDI1P32340 SCC4YER147C 1875 nt12.13□□□□□ -0.47
NDI1P32340 CUE1YMR264W 612 nt12.11□□□□□ -0.47
NDI1P32340 DSK2YMR276W 1122 nt12.11□□□□□ -0.47
NDI1P32340 IDH1YNL037C 1083 nt12.09□□□□□ -0.47
NDI1P32340 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.09□□□□□ -0.47
NDI1P32340 TAT1YBR069C 1860 nt12.08□□□□□ -0.48
NDI1P32340 FPS1YLL043W 2010 nt12.06□□□□□ -0.48
NDI1P32340 YLR236CYLR236C 324 nt12.02□□□□□ -0.49
NDI1P32340 YPR011CYPR011C 981 nt11.98□□□□□ -0.49
NDI1P32340 YIL100WYIL100W 354 nt11.97□□□□□ -0.49
NDI1P32340 GBP2YCL011C 1284 nt11.97□□□□□ -0.49
NDI1P32340 Q0182Q0182 405 nt11.94□□□□□ -0.5
NDI1P32340 FMP45YDL222C 930 nt11.91□□□□□ -0.5
NDI1P32340 ERV46YAL042W 1248 nt11.88□□□□□ -0.51
NDI1P32340 TCD2YKL027W 1344 nt11.87□□□□□ -0.51
NDI1P32340 YDR433WYDR433W 441 nt11.87□□□□□ -0.51
NDI1P32340 SEC11YIR022W 504 nt11.85□□□□□ -0.51
NDI1P32340 RRD1YIL153W 1182 nt11.84□□□□□ -0.51
NDI1P32340 YNL195CYNL195C 786 nt11.84□□□□□ -0.51
NDI1P32340 LPX1YOR084W 1164 nt11.82□□□□□ -0.52
NDI1P32340 YSC84YHR016C 1407 nt11.81□□□□□ -0.52
NDI1P32340 YKR040CYKR040C 504 nt11.79□□□□□ -0.52
NDI1P32340 DED1YOR204W 1815 nt11.79□□□□□ -0.52
NDI1P32340 FMP52YER004W 696 nt11.76□□□□□ -0.53
NDI1P32340 MXR2YCL033C 507 nt11.76□□□□□ -0.53
NDI1P32340 YHL050CYHL050C 2094 nt11.75□□□□□ -0.53
NDI1P32340 RRT12YCR045C 1476 nt11.75□□□□□ -0.53
NDI1P32340 MOT3YMR070W 1473 nt11.74□□□□□ -0.53
NDI1P32340 PCH2YBR186W 1695 nt11.73□□□□□ -0.53
NDI1P32340 YJL225CYJL225C 5277 nt11.69□□□□□ -0.54
NDI1P32340 FMT1YBL013W 1206 nt11.68□□□□□ -0.54
NDI1P32340 GUT2YIL155C 1950 nt11.66□□□□□ -0.54
NDI1P32340 SOR2YDL246C 1074 nt11.65□□□□□ -0.54
NDI1P32340 SOR1YJR159W 1074 nt11.65□□□□□ -0.54
NDI1P32340 YCL042WYCL042W 360 nt11.63□□□□□ -0.55
NDI1P32340 FRD1YEL047C 1413 nt11.6□□□□□ -0.55
NDI1P32340 PCM1YEL058W 1674 nt11.59□□□□□ -0.55
NDI1P32340 CWP1YKL096W 720 nt11.58□□□□□ -0.56
NDI1P32340 ADH2YMR303C 1047 nt11.56□□□□□ -0.56
NDI1P32340 PAC11YDR488C 1602 nt11.56□□□□□ -0.56
NDI1P32340 SNF6YHL025W 999 nt11.53□□□□□ -0.56
NDI1P32340 SPP1YPL138C 1062 nt11.52□□□□□ -0.57
NDI1P32340 BOP3YNL042W 1191 nt11.49□□□□□ -0.57
NDI1P32340 RTF1YGL244W 1677 nt11.49□□□□□ -0.57
NDI1P32340 PIB2YGL023C 1908 nt11.47□□□□□ -0.57
NDI1P32340 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.45□□□□□ -0.58
NDI1P32340 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.45□□□□□ -0.58
NDI1P32340 LCB1YMR296C 1677 nt11.44□□□□□ -0.58
NDI1P32340 SIM1YIL123W 1431 nt11.43□□□□□ -0.58
NDI1P32340 NCP1YHR042W 2076 nt11.43□□□□□ -0.58
NDI1P32340 YIH1YCR059C 777 nt11.42□□□□□ -0.58
NDI1P32340 NVJ2YPR091C 2313 nt11.4□□□□□ -0.58
NDI1P32340 BIO4YNR057C 714 nt11.4□□□□□ -0.58
NDI1P32340 RNQ1YCL028W 1218 nt11.4□□□□□ -0.58
NDI1P32340 YLR235CYLR235C 399 nt11.39□□□□□ -0.59
NDI1P32340 DIC1YLR348C 897 nt11.36□□□□□ -0.59
NDI1P32340 PTH1YHR189W 573 nt11.35□□□□□ -0.59
NDI1P32340 MRPL8YJL063C 717 nt11.31□□□□□ -0.6
NDI1P32340 RTG1YOL067C 534 nt11.31□□□□□ -0.6
NDI1P32340 YKL030WYKL030W 606 nt11.29□□□□□ -0.6
NDI1P32340 YLL053CYLL053C 459 nt11.29□□□□□ -0.6
NDI1P32340 PTK1YKL198C 1989 nt11.28□□□□□ -0.6
NDI1P32340 ERF2YLR246W 1080 nt11.27□□□□□ -0.61
NDI1P32340 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.25□□□□□ -0.61
NDI1P32340 YEL076CYEL076C 651 nt11.25□□□□□ -0.61
NDI1P32340 YLR464WYLR464W 651 nt11.25□□□□□ -0.61
NDI1P32340 TIM23YNR017W 669 nt11.25□□□□□ -0.61
NDI1P32340 FTR1YER145C 1215 nt11.24□□□□□ -0.61
NDI1P32340 ADO1YJR105W 1023 nt11.21□□□□□ -0.61
NDI1P32340 CRR1YLR213C 1269 nt11.21□□□□□ -0.61
NDI1P32340 AQY1YPR192W 918 nt11.21□□□□□ -0.61
NDI1P32340 LYS4YDR234W 2082 nt11.2□□□□□ -0.62
NDI1P32340 YLR179CYLR179C 606 nt11.19□□□□□ -0.62
NDI1P32340 GAL1YBR020W 1587 nt11.18□□□□□ -0.62
NDI1P32340 YFL067WYFL067W 528 nt11.17□□□□□ -0.62
NDI1P32340 HUA1YGR268C 597 nt11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms