Protein–RNA interactions for Protein: P31025

LCN1, Lipocalin-1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P31025 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCN1P31025 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCN1P31025 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCN1P31025 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCN1P31025 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCN1P31025 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LCN1P31025 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LCN1P31025 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LCN1P31025 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LCN1P31025 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCN1P31025 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCN1P31025 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCN1P31025 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCN1P31025 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCN1P31025 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCN1P31025 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCN1P31025 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCN1P31025 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCN1P31025 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCN1P31025 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCN1P31025 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCN1P31025 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCN1P31025 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCN1P31025 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCN1P31025 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LCN1P31025 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LCN1P31025 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LCN1P31025 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LCN1P31025 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LCN1P31025 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCN1P31025 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCN1P31025 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCN1P31025 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCN1P31025 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LCN1P31025 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCN1P31025 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCN1P31025 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LCN1P31025 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCN1P31025 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCN1P31025 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCN1P31025 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCN1P31025 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LCN1P31025 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCN1P31025 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCN1P31025 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCN1P31025 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCN1P31025 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCN1P31025 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LCN1P31025 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LCN1P31025 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LCN1P31025 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCN1P31025 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCN1P31025 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCN1P31025 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCN1P31025 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCN1P31025 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCN1P31025 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCN1P31025 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCN1P31025 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LCN1P31025 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCN1P31025 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCN1P31025 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCN1P31025 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCN1P31025 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCN1P31025 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCN1P31025 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCN1P31025 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCN1P31025 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCN1P31025 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCN1P31025 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LCN1P31025 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCN1P31025 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCN1P31025 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCN1P31025 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LCN1P31025 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCN1P31025 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCN1P31025 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCN1P31025 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCN1P31025 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCN1P31025 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCN1P31025 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCN1P31025 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCN1P31025 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCN1P31025 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCN1P31025 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCN1P31025 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCN1P31025 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCN1P31025 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCN1P31025 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCN1P31025 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCN1P31025 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCN1P31025 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCN1P31025 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCN1P31025 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCN1P31025 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCN1P31025 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCN1P31025 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCN1P31025 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCN1P31025 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCN1P31025 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms