Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VARSP26640 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VARSP26640 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VARSP26640 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VARSP26640 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
VARSP26640 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VARSP26640 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VARSP26640 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VARSP26640 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VARSP26640 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VARSP26640 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VARSP26640 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VARSP26640 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VARSP26640 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VARSP26640 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VARSP26640 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VARSP26640 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
VARSP26640 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VARSP26640 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VARSP26640 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VARSP26640 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VARSP26640 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VARSP26640 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VARSP26640 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VARSP26640 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VARSP26640 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VARSP26640 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VARSP26640 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VARSP26640 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VARSP26640 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VARSP26640 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VARSP26640 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VARSP26640 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VARSP26640 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VARSP26640 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VARSP26640 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VARSP26640 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VARSP26640 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VARSP26640 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VARSP26640 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VARSP26640 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
VARSP26640 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VARSP26640 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VARSP26640 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VARSP26640 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VARSP26640 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VARSP26640 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VARSP26640 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VARSP26640 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VARSP26640 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VARSP26640 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VARSP26640 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VARSP26640 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VARSP26640 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VARSP26640 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VARSP26640 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VARSP26640 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VARSP26640 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VARSP26640 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VARSP26640 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VARSP26640 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VARSP26640 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VARSP26640 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VARSP26640 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VARSP26640 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VARSP26640 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VARSP26640 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VARSP26640 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VARSP26640 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VARSP26640 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VARSP26640 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VARSP26640 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VARSP26640 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
VARSP26640 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VARSP26640 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VARSP26640 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VARSP26640 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VARSP26640 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VARSP26640 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VARSP26640 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VARSP26640 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VARSP26640 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VARSP26640 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VARSP26640 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VARSP26640 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VARSP26640 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VARSP26640 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
VARSP26640 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VARSP26640 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VARSP26640 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VARSP26640 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VARSP26640 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VARSP26640 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VARSP26640 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VARSP26640 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VARSP26640 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VARSP26640 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VARSP26640 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VARSP26640 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VARSP26640 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms