Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO1P25800 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO1P25800 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO1P25800 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO1P25800 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO1P25800 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO1P25800 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO1P25800 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO1P25800 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO1P25800 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO1P25800 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO1P25800 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO1P25800 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO1P25800 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMO1P25800 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMO1P25800 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO1P25800 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO1P25800 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO1P25800 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO1P25800 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO1P25800 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMO1P25800 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMO1P25800 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO1P25800 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO1P25800 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMO1P25800 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO1P25800 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO1P25800 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO1P25800 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO1P25800 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO1P25800 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO1P25800 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO1P25800 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO1P25800 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMO1P25800 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO1P25800 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO1P25800 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO1P25800 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO1P25800 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO1P25800 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO1P25800 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO1P25800 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO1P25800 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO1P25800 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO1P25800 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMO1P25800 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO1P25800 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO1P25800 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMO1P25800 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO1P25800 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO1P25800 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO1P25800 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO1P25800 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO1P25800 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO1P25800 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO1P25800 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO1P25800 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO1P25800 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO1P25800 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO1P25800 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO1P25800 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO1P25800 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO1P25800 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO1P25800 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMO1P25800 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO1P25800 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO1P25800 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO1P25800 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO1P25800 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO1P25800 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO1P25800 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO1P25800 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO1P25800 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO1P25800 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO1P25800 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO1P25800 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO1P25800 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO1P25800 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO1P25800 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO1P25800 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO1P25800 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO1P25800 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMO1P25800 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO1P25800 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO1P25800 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO1P25800 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO1P25800 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO1P25800 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO1P25800 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO1P25800 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO1P25800 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO1P25800 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMO1P25800 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMO1P25800 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO1P25800 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMO1P25800 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO1P25800 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO1P25800 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO1P25800 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMO1P25800 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms