Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMY2BP19961 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMY2BP19961 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMY2BP19961 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMY2BP19961 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMY2BP19961 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMY2BP19961 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMY2BP19961 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AMY2BP19961 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMY2BP19961 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMY2BP19961 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMY2BP19961 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AMY2BP19961 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMY2BP19961 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMY2BP19961 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMY2BP19961 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AMY2BP19961 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMY2BP19961 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMY2BP19961 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMY2BP19961 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMY2BP19961 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMY2BP19961 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMY2BP19961 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMY2BP19961 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMY2BP19961 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMY2BP19961 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMY2BP19961 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMY2BP19961 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMY2BP19961 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMY2BP19961 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMY2BP19961 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMY2BP19961 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMY2BP19961 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMY2BP19961 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMY2BP19961 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMY2BP19961 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMY2BP19961 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMY2BP19961 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMY2BP19961 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMY2BP19961 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMY2BP19961 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMY2BP19961 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMY2BP19961 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMY2BP19961 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMY2BP19961 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMY2BP19961 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMY2BP19961 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMY2BP19961 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMY2BP19961 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMY2BP19961 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMY2BP19961 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMY2BP19961 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMY2BP19961 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMY2BP19961 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMY2BP19961 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMY2BP19961 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMY2BP19961 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMY2BP19961 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMY2BP19961 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMY2BP19961 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMY2BP19961 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AMY2BP19961 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMY2BP19961 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMY2BP19961 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMY2BP19961 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMY2BP19961 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMY2BP19961 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMY2BP19961 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMY2BP19961 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMY2BP19961 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMY2BP19961 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMY2BP19961 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMY2BP19961 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMY2BP19961 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMY2BP19961 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMY2BP19961 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMY2BP19961 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMY2BP19961 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMY2BP19961 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMY2BP19961 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMY2BP19961 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMY2BP19961 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMY2BP19961 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMY2BP19961 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMY2BP19961 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMY2BP19961 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMY2BP19961 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AMY2BP19961 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMY2BP19961 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms