Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHRNB2P17787 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHRNB2P17787 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHRNB2P17787 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHRNB2P17787 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHRNB2P17787 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHRNB2P17787 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHRNB2P17787 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHRNB2P17787 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHRNB2P17787 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHRNB2P17787 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHRNB2P17787 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHRNB2P17787 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHRNB2P17787 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHRNB2P17787 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHRNB2P17787 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CHRNB2P17787 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHRNB2P17787 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHRNB2P17787 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHRNB2P17787 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHRNB2P17787 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHRNB2P17787 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHRNB2P17787 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHRNB2P17787 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHRNB2P17787 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHRNB2P17787 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHRNB2P17787 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHRNB2P17787 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHRNB2P17787 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHRNB2P17787 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHRNB2P17787 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CHRNB2P17787 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHRNB2P17787 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHRNB2P17787 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHRNB2P17787 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHRNB2P17787 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHRNB2P17787 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHRNB2P17787 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHRNB2P17787 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHRNB2P17787 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHRNB2P17787 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHRNB2P17787 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHRNB2P17787 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHRNB2P17787 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHRNB2P17787 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHRNB2P17787 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHRNB2P17787 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHRNB2P17787 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHRNB2P17787 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHRNB2P17787 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHRNB2P17787 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHRNB2P17787 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHRNB2P17787 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHRNB2P17787 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHRNB2P17787 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHRNB2P17787 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHRNB2P17787 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHRNB2P17787 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHRNB2P17787 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHRNB2P17787 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHRNB2P17787 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNB2P17787 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNB2P17787 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNB2P17787 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNB2P17787 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNB2P17787 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNB2P17787 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNB2P17787 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHRNB2P17787 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHRNB2P17787 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHRNB2P17787 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHRNB2P17787 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHRNB2P17787 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHRNB2P17787 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHRNB2P17787 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHRNB2P17787 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHRNB2P17787 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHRNB2P17787 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHRNB2P17787 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHRNB2P17787 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CHRNB2P17787 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNB2P17787 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHRNB2P17787 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHRNB2P17787 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHRNB2P17787 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHRNB2P17787 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHRNB2P17787 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHRNB2P17787 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHRNB2P17787 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHRNB2P17787 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHRNB2P17787 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CHRNB2P17787 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHRNB2P17787 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHRNB2P17787 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHRNB2P17787 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHRNB2P17787 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHRNB2P17787 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNB2P17787 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNB2P17787 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNB2P17787 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms