Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf88P0DMB2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf88P0DMB2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf88P0DMB2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf88P0DMB2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf88P0DMB2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf88P0DMB2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf88P0DMB2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf88P0DMB2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf88P0DMB2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf88P0DMB2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf88P0DMB2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf88P0DMB2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf88P0DMB2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf88P0DMB2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf88P0DMB2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf88P0DMB2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf88P0DMB2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf88P0DMB2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf88P0DMB2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf88P0DMB2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf88P0DMB2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf88P0DMB2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf88P0DMB2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf88P0DMB2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf88P0DMB2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf88P0DMB2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf88P0DMB2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf88P0DMB2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf88P0DMB2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf88P0DMB2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf88P0DMB2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf88P0DMB2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8orf88P0DMB2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf88P0DMB2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf88P0DMB2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf88P0DMB2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf88P0DMB2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf88P0DMB2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf88P0DMB2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf88P0DMB2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf88P0DMB2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf88P0DMB2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf88P0DMB2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf88P0DMB2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf88P0DMB2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf88P0DMB2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf88P0DMB2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf88P0DMB2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf88P0DMB2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf88P0DMB2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf88P0DMB2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf88P0DMB2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf88P0DMB2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf88P0DMB2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf88P0DMB2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf88P0DMB2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf88P0DMB2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf88P0DMB2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf88P0DMB2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf88P0DMB2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf88P0DMB2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf88P0DMB2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf88P0DMB2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf88P0DMB2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf88P0DMB2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf88P0DMB2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf88P0DMB2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf88P0DMB2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf88P0DMB2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C8orf88P0DMB2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf88P0DMB2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf88P0DMB2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf88P0DMB2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf88P0DMB2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf88P0DMB2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf88P0DMB2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf88P0DMB2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf88P0DMB2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf88P0DMB2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf88P0DMB2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf88P0DMB2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf88P0DMB2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf88P0DMB2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf88P0DMB2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C8orf88P0DMB2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C8orf88P0DMB2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C8orf88P0DMB2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C8orf88P0DMB2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C8orf88P0DMB2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C8orf88P0DMB2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C8orf88P0DMB2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C8orf88P0DMB2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C8orf88P0DMB2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C8orf88P0DMB2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C8orf88P0DMB2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C8orf88P0DMB2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C8orf88P0DMB2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf88P0DMB2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8orf88P0DMB2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms