Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC2BP0DI82 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC2BP0DI82 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC2BP0DI82 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC2BP0DI82 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC2BP0DI82 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC2BP0DI82 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC2BP0DI82 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC2BP0DI82 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC2BP0DI82 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC2BP0DI82 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC2BP0DI82 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC2BP0DI82 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC2BP0DI82 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC2BP0DI82 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC2BP0DI82 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC2BP0DI82 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC2BP0DI82 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC2BP0DI82 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAPPC2BP0DI82 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC2BP0DI82 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC2BP0DI82 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC2BP0DI82 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC2BP0DI82 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC2BP0DI82 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC2BP0DI82 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC2BP0DI82 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC2BP0DI82 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC2BP0DI82 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC2BP0DI82 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC2BP0DI82 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC2BP0DI82 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC2BP0DI82 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC2BP0DI82 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC2BP0DI82 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC2BP0DI82 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC2BP0DI82 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC2BP0DI82 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC2BP0DI82 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC2BP0DI82 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC2BP0DI82 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC2BP0DI82 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC2BP0DI82 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC2BP0DI82 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC2BP0DI82 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC2BP0DI82 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC2BP0DI82 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC2BP0DI82 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC2BP0DI82 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC2BP0DI82 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC2BP0DI82 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC2BP0DI82 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC2BP0DI82 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC2BP0DI82 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC2BP0DI82 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC2BP0DI82 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC2BP0DI82 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC2BP0DI82 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC2BP0DI82 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC2BP0DI82 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC2BP0DI82 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC2BP0DI82 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC2BP0DI82 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC2BP0DI82 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC2BP0DI82 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC2BP0DI82 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC2BP0DI82 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC2BP0DI82 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC2BP0DI82 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC2BP0DI82 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC2BP0DI82 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC2BP0DI82 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC2BP0DI82 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC2BP0DI82 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC2BP0DI82 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC2BP0DI82 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC2BP0DI82 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC2BP0DI82 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC2BP0DI82 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC2BP0DI82 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC2BP0DI82 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC2BP0DI82 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC2BP0DI82 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms