Protein–RNA interactions for Protein: P0CX38

RPS6B, 40S ribosomal protein S6-B, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS6BP0CX38 YBR220CYBR220C 1683 nt13.53□□□□□ -0.24
RPS6BP0CX38 YMR090WYMR090W 684 nt13.48□□□□□ -0.25
RPS6BP0CX38 ART5YGR068C 1761 nt13.47□□□□□ -0.25
RPS6BP0CX38 IRC15YPL017C 1500 nt13.45□□□□□ -0.26
RPS6BP0CX38 SDH1YKL148C 1923 nt13.43□□□□□ -0.26
RPS6BP0CX38 GFD2YCL036W 1701 nt13.43□□□□□ -0.26
RPS6BP0CX38 TAT1YBR069C 1860 nt13.41□□□□□ -0.26
RPS6BP0CX38 YOR139CYOR139C 393 nt13.37□□□□□ -0.27
RPS6BP0CX38 TIR4YOR009W 1464 nt13.36□□□□□ -0.27
RPS6BP0CX38 GIS3YLR094C 1509 nt13.35□□□□□ -0.27
RPS6BP0CX38 RTS2YOR077W 699 nt13.32□□□□□ -0.28
RPS6BP0CX38 SCC4YER147C 1875 nt13.31□□□□□ -0.28
RPS6BP0CX38 NPL3YDR432W 1245 nt13.3□□□□□ -0.28
RPS6BP0CX38 PET9YBL030C 957 nt13.3□□□□□ -0.28
RPS6BP0CX38 YOL037CYOL037C 354 nt13.29□□□□□ -0.28
RPS6BP0CX38 YMR057CYMR057C 372 nt13.23□□□□□ -0.29
RPS6BP0CX38 YCH1YGR203W 447 nt13.2□□□□□ -0.3
RPS6BP0CX38 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.2□□□□□ -0.3
RPS6BP0CX38 YJL152WYJL152W 360 nt13.14□□□□□ -0.31
RPS6BP0CX38 CUE1YMR264W 612 nt13.14□□□□□ -0.31
RPS6BP0CX38 FPS1YLL043W 2010 nt13.12□□□□□ -0.31
RPS6BP0CX38 YGR139WYGR139W 339 nt13.1□□□□□ -0.31
RPS6BP0CX38 YLR281CYLR281C 468 nt13.08□□□□□ -0.32
RPS6BP0CX38 WHI5YOR083W 888 nt13.08□□□□□ -0.32
RPS6BP0CX38 YSC84YHR016C 1407 nt13.04□□□□□ -0.32
RPS6BP0CX38 YHL050CYHL050C 2094 nt13.02□□□□□ -0.33
RPS6BP0CX38 PCH2YBR186W 1695 nt13□□□□□ -0.33
RPS6BP0CX38 NME1NME1 340 nt13□□□□□ -0.33
RPS6BP0CX38 RRT12YCR045C 1476 nt12.99□□□□□ -0.33
RPS6BP0CX38 GUT2YIL155C 1950 nt12.96□□□□□ -0.33
RPS6BP0CX38 SEC11YIR022W 504 nt12.96□□□□□ -0.33
RPS6BP0CX38 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.94□□□□□ -0.34
RPS6BP0CX38 YIL100WYIL100W 354 nt12.93□□□□□ -0.34
RPS6BP0CX38 YLR236CYLR236C 324 nt12.9□□□□□ -0.34
RPS6BP0CX38 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.86□□□□□ -0.35
RPS6BP0CX38 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.86□□□□□ -0.35
RPS6BP0CX38 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.86□□□□□ -0.35
RPS6BP0CX38 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.86□□□□□ -0.35
RPS6BP0CX38 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.86□□□□□ -0.35
RPS6BP0CX38 PIB2YGL023C 1908 nt12.86□□□□□ -0.35
RPS6BP0CX38 PUS2YGL063W 1113 nt12.85□□□□□ -0.35
RPS6BP0CX38 YPR011CYPR011C 981 nt12.82□□□□□ -0.36
RPS6BP0CX38 YNL195CYNL195C 786 nt12.81□□□□□ -0.36
RPS6BP0CX38 IDH1YNL037C 1083 nt12.79□□□□□ -0.36
RPS6BP0CX38 RRD1YIL153W 1182 nt12.78□□□□□ -0.36
RPS6BP0CX38 GBP2YCL011C 1284 nt12.77□□□□□ -0.37
RPS6BP0CX38 DSK2YMR276W 1122 nt12.75□□□□□ -0.37
RPS6BP0CX38 DED1YOR204W 1815 nt12.75□□□□□ -0.37
RPS6BP0CX38 RTF1YGL244W 1677 nt12.7□□□□□ -0.38
RPS6BP0CX38 IMP2'YIL154C 1041 nt12.67□□□□□ -0.38
RPS6BP0CX38 NCP1YHR042W 2076 nt12.65□□□□□ -0.38
RPS6BP0CX38 FMT1YBL013W 1206 nt12.65□□□□□ -0.38
RPS6BP0CX38 MXR2YCL033C 507 nt12.64□□□□□ -0.39
RPS6BP0CX38 TCD2YKL027W 1344 nt12.63□□□□□ -0.39
RPS6BP0CX38 FMP45YDL222C 930 nt12.63□□□□□ -0.39
RPS6BP0CX38 YDR433WYDR433W 441 nt12.62□□□□□ -0.39
RPS6BP0CX38 BOP3YNL042W 1191 nt12.59□□□□□ -0.39
RPS6BP0CX38 LPX1YOR084W 1164 nt12.59□□□□□ -0.39
RPS6BP0CX38 PTK1YKL198C 1989 nt12.58□□□□□ -0.4
RPS6BP0CX38 LCB1YMR296C 1677 nt12.57□□□□□ -0.4
RPS6BP0CX38 FMP52YER004W 696 nt12.55□□□□□ -0.4
RPS6BP0CX38 ERV46YAL042W 1248 nt12.54□□□□□ -0.4
RPS6BP0CX38 PCM1YEL058W 1674 nt12.54□□□□□ -0.4
RPS6BP0CX38 ADH2YMR303C 1047 nt12.51□□□□□ -0.41
RPS6BP0CX38 CWP1YKL096W 720 nt12.49□□□□□ -0.41
RPS6BP0CX38 YKR040CYKR040C 504 nt12.46□□□□□ -0.41
RPS6BP0CX38 PAC11YDR488C 1602 nt12.44□□□□□ -0.42
RPS6BP0CX38 SOR2YDL246C 1074 nt12.43□□□□□ -0.42
RPS6BP0CX38 SOR1YJR159W 1074 nt12.43□□□□□ -0.42
RPS6BP0CX38 FRD1YEL047C 1413 nt12.42□□□□□ -0.42
RPS6BP0CX38 SIM1YIL123W 1431 nt12.41□□□□□ -0.42
RPS6BP0CX38 SNF6YHL025W 999 nt12.39□□□□□ -0.43
RPS6BP0CX38 BIO4YNR057C 714 nt12.36□□□□□ -0.43
RPS6BP0CX38 YCL042WYCL042W 360 nt12.36□□□□□ -0.43
RPS6BP0CX38 LYS4YDR234W 2082 nt12.34□□□□□ -0.43
RPS6BP0CX38 SPP1YPL138C 1062 nt12.3□□□□□ -0.44
RPS6BP0CX38 YFL054CYFL054C 1941 nt12.28□□□□□ -0.44
RPS6BP0CX38 YIH1YCR059C 777 nt12.25□□□□□ -0.45
RPS6BP0CX38 YLL053CYLL053C 459 nt12.21□□□□□ -0.45
RPS6BP0CX38 RNQ1YCL028W 1218 nt12.21□□□□□ -0.45
RPS6BP0CX38 SPT8YLR055C 1809 nt12.2□□□□□ -0.46
RPS6BP0CX38 DIC1YLR348C 897 nt12.15□□□□□ -0.46
RPS6BP0CX38 PTH1YHR189W 573 nt12.14□□□□□ -0.47
RPS6BP0CX38 CRR1YLR213C 1269 nt12.13□□□□□ -0.47
RPS6BP0CX38 ATF2YGR177C 1608 nt12.12□□□□□ -0.47
RPS6BP0CX38 ERF2YLR246W 1080 nt12.12□□□□□ -0.47
RPS6BP0CX38 FTR1YER145C 1215 nt12.08□□□□□ -0.48
RPS6BP0CX38 CSM2YIL132C 642 nt12.08□□□□□ -0.48
RPS6BP0CX38 MIC10YCL057C-A 294 nt12.07□□□□□ -0.48
RPS6BP0CX38 GAL1YBR020W 1587 nt12.06□□□□□ -0.48
RPS6BP0CX38 TRM5YHR070W 1500 nt12.06□□□□□ -0.48
RPS6BP0CX38 SWE1YJL187C 2460 nt12.02□□□□□ -0.49
RPS6BP0CX38 SNG1YGR197C 1644 nt12.01□□□□□ -0.49
RPS6BP0CX38 HEM12YDR047W 1089 nt11.99□□□□□ -0.49
RPS6BP0CX38 YLR235CYLR235C 399 nt11.99□□□□□ -0.49
RPS6BP0CX38 YFL067WYFL067W 528 nt11.97□□□□□ -0.49
RPS6BP0CX38 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.97□□□□□ -0.49
RPS6BP0CX38 TIM23YNR017W 669 nt11.96□□□□□ -0.49
RPS6BP0CX38 YLR179CYLR179C 606 nt11.93□□□□□ -0.5
RPS6BP0CX38 DDR2YOL052C-A 186 nt11.93□□□□□ -0.5
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