Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y9

H2AFB1, Histone H2A-Bbd type 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFB1P0C5Y9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFB1P0C5Y9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFB1P0C5Y9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFB1P0C5Y9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFB1P0C5Y9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFB1P0C5Y9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFB1P0C5Y9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFB1P0C5Y9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2AFB1P0C5Y9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFB1P0C5Y9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFB1P0C5Y9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFB1P0C5Y9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFB1P0C5Y9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFB1P0C5Y9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFB1P0C5Y9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFB1P0C5Y9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFB1P0C5Y9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFB1P0C5Y9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFB1P0C5Y9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFB1P0C5Y9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFB1P0C5Y9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFB1P0C5Y9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFB1P0C5Y9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFB1P0C5Y9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFB1P0C5Y9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFB1P0C5Y9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFB1P0C5Y9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2AFB1P0C5Y9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2AFB1P0C5Y9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2AFB1P0C5Y9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFB1P0C5Y9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2AFB1P0C5Y9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2AFB1P0C5Y9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2AFB1P0C5Y9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2AFB1P0C5Y9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFB1P0C5Y9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFB1P0C5Y9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFB1P0C5Y9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFB1P0C5Y9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFB1P0C5Y9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFB1P0C5Y9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFB1P0C5Y9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFB1P0C5Y9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFB1P0C5Y9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFB1P0C5Y9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFB1P0C5Y9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFB1P0C5Y9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFB1P0C5Y9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFB1P0C5Y9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFB1P0C5Y9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
H2AFB1P0C5Y9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFB1P0C5Y9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFB1P0C5Y9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFB1P0C5Y9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2AFB1P0C5Y9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFB1P0C5Y9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFB1P0C5Y9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFB1P0C5Y9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFB1P0C5Y9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFB1P0C5Y9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFB1P0C5Y9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFB1P0C5Y9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFB1P0C5Y9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFB1P0C5Y9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFB1P0C5Y9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFB1P0C5Y9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFB1P0C5Y9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFB1P0C5Y9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFB1P0C5Y9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFB1P0C5Y9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFB1P0C5Y9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFB1P0C5Y9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFB1P0C5Y9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFB1P0C5Y9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFB1P0C5Y9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFB1P0C5Y9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFB1P0C5Y9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFB1P0C5Y9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFB1P0C5Y9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFB1P0C5Y9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFB1P0C5Y9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFB1P0C5Y9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFB1P0C5Y9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFB1P0C5Y9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFB1P0C5Y9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFB1P0C5Y9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFB1P0C5Y9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFB1P0C5Y9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFB1P0C5Y9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFB1P0C5Y9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2AFB1P0C5Y9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2AFB1P0C5Y9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFB1P0C5Y9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFB1P0C5Y9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFB1P0C5Y9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFB1P0C5Y9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFB1P0C5Y9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFB1P0C5Y9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFB1P0C5Y9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2AFB1P0C5Y9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms