Protein–RNA interactions for Protein: P09228

CST2, Cystatin-SA, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST2P09228 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CST2P09228 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CST2P09228 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST2P09228 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST2P09228 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CST2P09228 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CST2P09228 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CST2P09228 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CST2P09228 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CST2P09228 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CST2P09228 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CST2P09228 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CST2P09228 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CST2P09228 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CST2P09228 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CST2P09228 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CST2P09228 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CST2P09228 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CST2P09228 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CST2P09228 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CST2P09228 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CST2P09228 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CST2P09228 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CST2P09228 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CST2P09228 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CST2P09228 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CST2P09228 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CST2P09228 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CST2P09228 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CST2P09228 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CST2P09228 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CST2P09228 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CST2P09228 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CST2P09228 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CST2P09228 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CST2P09228 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CST2P09228 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CST2P09228 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CST2P09228 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CST2P09228 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CST2P09228 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CST2P09228 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CST2P09228 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CST2P09228 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CST2P09228 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CST2P09228 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CST2P09228 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CST2P09228 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CST2P09228 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CST2P09228 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CST2P09228 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CST2P09228 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CST2P09228 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CST2P09228 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CST2P09228 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CST2P09228 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CST2P09228 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CST2P09228 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CST2P09228 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CST2P09228 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CST2P09228 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CST2P09228 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CST2P09228 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CST2P09228 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CST2P09228 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CST2P09228 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CST2P09228 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CST2P09228 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CST2P09228 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CST2P09228 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CST2P09228 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CST2P09228 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CST2P09228 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CST2P09228 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CST2P09228 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CST2P09228 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CST2P09228 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CST2P09228 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CST2P09228 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CST2P09228 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CST2P09228 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CST2P09228 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CST2P09228 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CST2P09228 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CST2P09228 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CST2P09228 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CST2P09228 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CST2P09228 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CST2P09228 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CST2P09228 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CST2P09228 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CST2P09228 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CST2P09228 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CST2P09228 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CST2P09228 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CST2P09228 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CST2P09228 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CST2P09228 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CST2P09228 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CST2P09228 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms