Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOC1P02654 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOC1P02654 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC1P02654 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC1P02654 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOC1P02654 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOC1P02654 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOC1P02654 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOC1P02654 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOC1P02654 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC1P02654 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC1P02654 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOC1P02654 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOC1P02654 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOC1P02654 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOC1P02654 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC1P02654 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC1P02654 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC1P02654 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOC1P02654 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOC1P02654 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOC1P02654 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOC1P02654 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC1P02654 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC1P02654 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC1P02654 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOC1P02654 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOC1P02654 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOC1P02654 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOC1P02654 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOC1P02654 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOC1P02654 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOC1P02654 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOC1P02654 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOC1P02654 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOC1P02654 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOC1P02654 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOC1P02654 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOC1P02654 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOC1P02654 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOC1P02654 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOC1P02654 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOC1P02654 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOC1P02654 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOC1P02654 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
APOC1P02654 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOC1P02654 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOC1P02654 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOC1P02654 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOC1P02654 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOC1P02654 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOC1P02654 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOC1P02654 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOC1P02654 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOC1P02654 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOC1P02654 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOC1P02654 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOC1P02654 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOC1P02654 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOC1P02654 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOC1P02654 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOC1P02654 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOC1P02654 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOC1P02654 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOC1P02654 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOC1P02654 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC1P02654 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC1P02654 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC1P02654 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOC1P02654 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOC1P02654 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOC1P02654 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOC1P02654 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOC1P02654 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOC1P02654 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOC1P02654 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOC1P02654 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOC1P02654 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC1P02654 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC1P02654 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC1P02654 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC1P02654 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC1P02654 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC1P02654 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC1P02654 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOC1P02654 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOC1P02654 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC1P02654 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC1P02654 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC1P02654 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOC1P02654 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOC1P02654 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC1P02654 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOC1P02654 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOC1P02654 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC1P02654 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC1P02654 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC1P02654 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC1P02654 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOC1P02654 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms