Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TGFB1P01137 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TGFB1P01137 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TGFB1P01137 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TGFB1P01137 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TGFB1P01137 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TGFB1P01137 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB1P01137 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TGFB1P01137 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB1P01137 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB1P01137 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGFB1P01137 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TGFB1P01137 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TGFB1P01137 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TGFB1P01137 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB1P01137 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB1P01137 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB1P01137 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGFB1P01137 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGFB1P01137 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGFB1P01137 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGFB1P01137 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TGFB1P01137 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TGFB1P01137 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TGFB1P01137 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TGFB1P01137 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TGFB1P01137 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TGFB1P01137 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TGFB1P01137 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TGFB1P01137 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TGFB1P01137 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TGFB1P01137 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TGFB1P01137 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TGFB1P01137 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TGFB1P01137 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TGFB1P01137 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TGFB1P01137 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TGFB1P01137 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TGFB1P01137 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TGFB1P01137 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TGFB1P01137 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TGFB1P01137 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TGFB1P01137 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TGFB1P01137 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TGFB1P01137 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TGFB1P01137 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TGFB1P01137 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TGFB1P01137 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TGFB1P01137 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TGFB1P01137 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TGFB1P01137 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TGFB1P01137 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TGFB1P01137 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TGFB1P01137 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TGFB1P01137 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TGFB1P01137 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TGFB1P01137 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TGFB1P01137 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TGFB1P01137 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TGFB1P01137 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TGFB1P01137 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TGFB1P01137 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TGFB1P01137 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TGFB1P01137 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TGFB1P01137 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TGFB1P01137 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TGFB1P01137 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TGFB1P01137 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TGFB1P01137 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TGFB1P01137 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TGFB1P01137 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TGFB1P01137 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TGFB1P01137 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGFB1P01137 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGFB1P01137 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TGFB1P01137 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGFB1P01137 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGFB1P01137 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGFB1P01137 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGFB1P01137 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGFB1P01137 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TGFB1P01137 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGFB1P01137 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGFB1P01137 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TGFB1P01137 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TGFB1P01137 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGFB1P01137 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TGFB1P01137 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGFB1P01137 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TGFB1P01137 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGFB1P01137 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGFB1P01137 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGFB1P01137 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGFB1P01137 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGFB1P01137 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGFB1P01137 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TGFB1P01137 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TGFB1P01137 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB1P01137 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB1P01137 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms