Protein–RNA interactions for Protein: P01036

CST4, Cystatin-S, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST4P01036 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CST4P01036 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CST4P01036 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CST4P01036 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CST4P01036 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CST4P01036 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CST4P01036 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CST4P01036 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CST4P01036 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CST4P01036 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CST4P01036 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CST4P01036 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CST4P01036 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CST4P01036 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CST4P01036 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CST4P01036 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CST4P01036 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CST4P01036 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CST4P01036 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CST4P01036 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CST4P01036 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CST4P01036 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CST4P01036 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CST4P01036 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST4P01036 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST4P01036 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CST4P01036 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CST4P01036 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CST4P01036 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CST4P01036 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CST4P01036 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CST4P01036 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CST4P01036 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CST4P01036 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CST4P01036 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CST4P01036 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CST4P01036 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST4P01036 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST4P01036 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST4P01036 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST4P01036 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST4P01036 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CST4P01036 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CST4P01036 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CST4P01036 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CST4P01036 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CST4P01036 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CST4P01036 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CST4P01036 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CST4P01036 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CST4P01036 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CST4P01036 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST4P01036 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST4P01036 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CST4P01036 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CST4P01036 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST4P01036 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CST4P01036 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CST4P01036 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CST4P01036 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CST4P01036 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CST4P01036 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CST4P01036 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CST4P01036 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CST4P01036 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CST4P01036 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CST4P01036 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CST4P01036 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CST4P01036 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST4P01036 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CST4P01036 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CST4P01036 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CST4P01036 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CST4P01036 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CST4P01036 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CST4P01036 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CST4P01036 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CST4P01036 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CST4P01036 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CST4P01036 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CST4P01036 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CST4P01036 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CST4P01036 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CST4P01036 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CST4P01036 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CST4P01036 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CST4P01036 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CST4P01036 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CST4P01036 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CST4P01036 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CST4P01036 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CST4P01036 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CST4P01036 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CST4P01036 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CST4P01036 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CST4P01036 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CST4P01036 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CST4P01036 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CST4P01036 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CST4P01036 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms