Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPC4O75487 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GPC4O75487 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC4O75487 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPC4O75487 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPC4O75487 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPC4O75487 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPC4O75487 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPC4O75487 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPC4O75487 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPC4O75487 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPC4O75487 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC4O75487 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC4O75487 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC4O75487 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPC4O75487 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPC4O75487 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPC4O75487 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPC4O75487 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC4O75487 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC4O75487 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC4O75487 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC4O75487 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC4O75487 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC4O75487 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC4O75487 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC4O75487 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GPC4O75487 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPC4O75487 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPC4O75487 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC4O75487 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPC4O75487 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPC4O75487 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC4O75487 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC4O75487 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC4O75487 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC4O75487 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPC4O75487 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPC4O75487 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC4O75487 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC4O75487 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC4O75487 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC4O75487 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC4O75487 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GPC4O75487 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC4O75487 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPC4O75487 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPC4O75487 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC4O75487 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPC4O75487 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GPC4O75487 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC4O75487 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC4O75487 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPC4O75487 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPC4O75487 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPC4O75487 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPC4O75487 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPC4O75487 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPC4O75487 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPC4O75487 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPC4O75487 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC4O75487 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC4O75487 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC4O75487 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC4O75487 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC4O75487 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC4O75487 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC4O75487 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC4O75487 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC4O75487 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC4O75487 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC4O75487 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC4O75487 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC4O75487 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC4O75487 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC4O75487 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GPC4O75487 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPC4O75487 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPC4O75487 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPC4O75487 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPC4O75487 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPC4O75487 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPC4O75487 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPC4O75487 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPC4O75487 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPC4O75487 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPC4O75487 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPC4O75487 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPC4O75487 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPC4O75487 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPC4O75487 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPC4O75487 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPC4O75487 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPC4O75487 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPC4O75487 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPC4O75487 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GPC4O75487 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPC4O75487 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC4O75487 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC4O75487 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms