Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ATP8B3O60423 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ATP8B3O60423 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATP8B3O60423 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP8B3O60423 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP8B3O60423 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATP8B3O60423 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATP8B3O60423 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP8B3O60423 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP8B3O60423 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP8B3O60423 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATP8B3O60423 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP8B3O60423 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP8B3O60423 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATP8B3O60423 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP8B3O60423 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP8B3O60423 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP8B3O60423 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP8B3O60423 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP8B3O60423 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP8B3O60423 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP8B3O60423 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP8B3O60423 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP8B3O60423 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATP8B3O60423 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATP8B3O60423 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATP8B3O60423 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP8B3O60423 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATP8B3O60423 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATP8B3O60423 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ATP8B3O60423 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATP8B3O60423 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATP8B3O60423 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP8B3O60423 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATP8B3O60423 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATP8B3O60423 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP8B3O60423 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATP8B3O60423 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP8B3O60423 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP8B3O60423 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP8B3O60423 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP8B3O60423 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATP8B3O60423 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATP8B3O60423 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP8B3O60423 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP8B3O60423 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP8B3O60423 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP8B3O60423 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP8B3O60423 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP8B3O60423 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP8B3O60423 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATP8B3O60423 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ATP8B3O60423 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ATP8B3O60423 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATP8B3O60423 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATP8B3O60423 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATP8B3O60423 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP8B3O60423 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP8B3O60423 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATP8B3O60423 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATP8B3O60423 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATP8B3O60423 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATP8B3O60423 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP8B3O60423 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP8B3O60423 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP8B3O60423 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP8B3O60423 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ATP8B3O60423 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP8B3O60423 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP8B3O60423 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP8B3O60423 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP8B3O60423 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP8B3O60423 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP8B3O60423 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP8B3O60423 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP8B3O60423 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP8B3O60423 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP8B3O60423 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP8B3O60423 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP8B3O60423 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP8B3O60423 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP8B3O60423 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP8B3O60423 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP8B3O60423 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP8B3O60423 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP8B3O60423 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP8B3O60423 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP8B3O60423 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP8B3O60423 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP8B3O60423 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP8B3O60423 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP8B3O60423 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP8B3O60423 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP8B3O60423 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP8B3O60423 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP8B3O60423 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP8B3O60423 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP8B3O60423 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP8B3O60423 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP8B3O60423 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms