Protein–RNA interactions for Protein: O43678

NDUFA2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA2O43678 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFA2O43678 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFA2O43678 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA2O43678 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFA2O43678 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFA2O43678 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFA2O43678 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFA2O43678 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFA2O43678 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFA2O43678 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFA2O43678 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFA2O43678 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDUFA2O43678 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDUFA2O43678 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFA2O43678 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFA2O43678 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFA2O43678 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFA2O43678 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFA2O43678 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFA2O43678 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFA2O43678 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFA2O43678 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFA2O43678 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFA2O43678 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFA2O43678 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFA2O43678 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDUFA2O43678 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFA2O43678 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFA2O43678 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFA2O43678 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFA2O43678 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFA2O43678 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFA2O43678 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFA2O43678 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFA2O43678 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFA2O43678 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFA2O43678 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFA2O43678 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFA2O43678 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFA2O43678 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFA2O43678 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFA2O43678 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFA2O43678 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFA2O43678 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFA2O43678 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFA2O43678 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFA2O43678 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFA2O43678 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFA2O43678 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFA2O43678 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFA2O43678 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFA2O43678 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFA2O43678 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFA2O43678 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFA2O43678 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFA2O43678 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFA2O43678 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFA2O43678 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFA2O43678 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFA2O43678 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFA2O43678 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFA2O43678 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFA2O43678 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFA2O43678 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFA2O43678 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFA2O43678 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFA2O43678 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFA2O43678 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFA2O43678 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFA2O43678 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFA2O43678 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFA2O43678 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFA2O43678 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA2O43678 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFA2O43678 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFA2O43678 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFA2O43678 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFA2O43678 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFA2O43678 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFA2O43678 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA2O43678 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA2O43678 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFA2O43678 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA2O43678 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA2O43678 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFA2O43678 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFA2O43678 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFA2O43678 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFA2O43678 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFA2O43678 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFA2O43678 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFA2O43678 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFA2O43678 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFA2O43678 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFA2O43678 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFA2O43678 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFA2O43678 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFA2O43678 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFA2O43678 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFA2O43678 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms