Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGCEO43556 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGCEO43556 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGCEO43556 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SGCEO43556 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGCEO43556 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGCEO43556 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGCEO43556 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGCEO43556 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGCEO43556 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGCEO43556 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGCEO43556 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGCEO43556 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGCEO43556 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGCEO43556 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGCEO43556 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGCEO43556 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGCEO43556 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCEO43556 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCEO43556 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCEO43556 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCEO43556 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGCEO43556 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGCEO43556 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGCEO43556 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGCEO43556 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGCEO43556 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGCEO43556 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGCEO43556 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGCEO43556 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGCEO43556 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGCEO43556 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCEO43556 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGCEO43556 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGCEO43556 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGCEO43556 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGCEO43556 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGCEO43556 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGCEO43556 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGCEO43556 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGCEO43556 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGCEO43556 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGCEO43556 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGCEO43556 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGCEO43556 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGCEO43556 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGCEO43556 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGCEO43556 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCEO43556 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCEO43556 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCEO43556 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGCEO43556 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGCEO43556 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGCEO43556 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGCEO43556 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGCEO43556 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGCEO43556 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGCEO43556 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGCEO43556 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCEO43556 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCEO43556 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCEO43556 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGCEO43556 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGCEO43556 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGCEO43556 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGCEO43556 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCEO43556 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCEO43556 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCEO43556 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGCEO43556 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGCEO43556 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCEO43556 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCEO43556 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCEO43556 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCEO43556 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCEO43556 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCEO43556 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGCEO43556 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGCEO43556 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGCEO43556 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGCEO43556 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGCEO43556 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGCEO43556 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCEO43556 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGCEO43556 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGCEO43556 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGCEO43556 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGCEO43556 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCEO43556 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCEO43556 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCEO43556 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCEO43556 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCEO43556 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCEO43556 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCEO43556 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCEO43556 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGCEO43556 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCEO43556 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCEO43556 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCEO43556 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms