Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCL22O00626 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCL22O00626 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCL22O00626 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCL22O00626 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCL22O00626 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCL22O00626 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCL22O00626 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCL22O00626 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCL22O00626 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCL22O00626 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCL22O00626 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCL22O00626 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCL22O00626 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCL22O00626 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCL22O00626 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCL22O00626 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCL22O00626 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCL22O00626 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCL22O00626 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCL22O00626 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL22O00626 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL22O00626 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCL22O00626 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCL22O00626 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCL22O00626 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCL22O00626 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCL22O00626 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCL22O00626 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCL22O00626 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCL22O00626 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCL22O00626 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCL22O00626 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCL22O00626 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCL22O00626 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCL22O00626 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCL22O00626 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCL22O00626 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCL22O00626 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCL22O00626 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCL22O00626 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCL22O00626 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCL22O00626 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCL22O00626 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCL22O00626 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCL22O00626 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCL22O00626 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCL22O00626 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCL22O00626 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CCL22O00626 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCL22O00626 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCL22O00626 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCL22O00626 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCL22O00626 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCL22O00626 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCL22O00626 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCL22O00626 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCL22O00626 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCL22O00626 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCL22O00626 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCL22O00626 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCL22O00626 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCL22O00626 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCL22O00626 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCL22O00626 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCL22O00626 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCL22O00626 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCL22O00626 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCL22O00626 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCL22O00626 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCL22O00626 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCL22O00626 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCL22O00626 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCL22O00626 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCL22O00626 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCL22O00626 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCL22O00626 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCL22O00626 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCL22O00626 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCL22O00626 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCL22O00626 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCL22O00626 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCL22O00626 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCL22O00626 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCL22O00626 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCL22O00626 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCL22O00626 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCL22O00626 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCL22O00626 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCL22O00626 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCL22O00626 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCL22O00626 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCL22O00626 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCL22O00626 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCL22O00626 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCL22O00626 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCL22O00626 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCL22O00626 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCL22O00626 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCL22O00626 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms