Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LAD1O00515 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LAD1O00515 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LAD1O00515 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LAD1O00515 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LAD1O00515 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LAD1O00515 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LAD1O00515 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LAD1O00515 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LAD1O00515 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
LAD1O00515 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAD1O00515 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAD1O00515 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAD1O00515 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAD1O00515 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAD1O00515 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAD1O00515 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LAD1O00515 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LAD1O00515 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LAD1O00515 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LAD1O00515 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LAD1O00515 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LAD1O00515 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAD1O00515 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAD1O00515 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LAD1O00515 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LAD1O00515 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LAD1O00515 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LAD1O00515 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LAD1O00515 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LAD1O00515 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LAD1O00515 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LAD1O00515 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LAD1O00515 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LAD1O00515 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LAD1O00515 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LAD1O00515 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LAD1O00515 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LAD1O00515 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAD1O00515 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAD1O00515 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAD1O00515 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAD1O00515 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAD1O00515 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LAD1O00515 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LAD1O00515 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LAD1O00515 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LAD1O00515 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LAD1O00515 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LAD1O00515 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LAD1O00515 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LAD1O00515 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LAD1O00515 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
LAD1O00515 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
LAD1O00515 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LAD1O00515 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LAD1O00515 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LAD1O00515 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LAD1O00515 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LAD1O00515 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LAD1O00515 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LAD1O00515 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LAD1O00515 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LAD1O00515 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LAD1O00515 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LAD1O00515 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LAD1O00515 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LAD1O00515 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LAD1O00515 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LAD1O00515 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LAD1O00515 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LAD1O00515 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LAD1O00515 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LAD1O00515 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
LAD1O00515 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LAD1O00515 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LAD1O00515 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LAD1O00515 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LAD1O00515 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LAD1O00515 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LAD1O00515 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LAD1O00515 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LAD1O00515 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LAD1O00515 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LAD1O00515 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LAD1O00515 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAD1O00515 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAD1O00515 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAD1O00515 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAD1O00515 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LAD1O00515 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LAD1O00515 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LAD1O00515 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAD1O00515 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAD1O00515 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAD1O00515 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LAD1O00515 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LAD1O00515 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LAD1O00515 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LAD1O00515 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms