Protein–RNA interactions for Protein: A6NLC8

Putative TAF11-like protein ENSP00000332601, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NLC8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A6NLC8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A6NLC8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A6NLC8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A6NLC8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A6NLC8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A6NLC8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A6NLC8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A6NLC8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A6NLC8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A6NLC8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NLC8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NLC8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NLC8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NLC8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A6NLC8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A6NLC8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A6NLC8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A6NLC8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A6NLC8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A6NLC8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A6NLC8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A6NLC8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A6NLC8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A6NLC8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A6NLC8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A6NLC8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A6NLC8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A6NLC8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A6NLC8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A6NLC8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A6NLC8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A6NLC8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A6NLC8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A6NLC8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A6NLC8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
A6NLC8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A6NLC8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A6NLC8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A6NLC8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NLC8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NLC8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NLC8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NLC8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NLC8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A6NLC8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A6NLC8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A6NLC8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A6NLC8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NLC8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NLC8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A6NLC8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NLC8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NLC8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A6NLC8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NLC8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NLC8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NLC8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NLC8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NLC8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NLC8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NLC8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NLC8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NLC8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NLC8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NLC8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NLC8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NLC8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NLC8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NLC8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NLC8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NLC8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NLC8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NLC8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NLC8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NLC8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NLC8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A6NLC8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A6NLC8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A6NLC8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
A6NLC8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A6NLC8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NLC8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NLC8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NLC8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NLC8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NLC8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NLC8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NLC8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NLC8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NLC8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NLC8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NLC8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NLC8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NLC8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A6NLC8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
A6NLC8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A6NLC8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A6NLC8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A6NLC8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms