Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A6NDN8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A6NDN8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
A6NDN8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A6NDN8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A6NDN8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A6NDN8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A6NDN8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A6NDN8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A6NDN8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A6NDN8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NDN8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A6NDN8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A6NDN8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A6NDN8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NDN8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A6NDN8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NDN8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A6NDN8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A6NDN8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A6NDN8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A6NDN8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A6NDN8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A6NDN8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A6NDN8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A6NDN8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A6NDN8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A6NDN8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A6NDN8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A6NDN8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A6NDN8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A6NDN8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A6NDN8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A6NDN8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A6NDN8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A6NDN8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A6NDN8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A6NDN8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A6NDN8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A6NDN8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A6NDN8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A6NDN8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A6NDN8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A6NDN8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
A6NDN8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A6NDN8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A6NDN8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A6NDN8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NDN8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A6NDN8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NDN8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NDN8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NDN8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NDN8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NDN8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NDN8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NDN8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A6NDN8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A6NDN8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A6NDN8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A6NDN8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A6NDN8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NDN8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A6NDN8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NDN8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NDN8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A6NDN8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A6NDN8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A6NDN8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NDN8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A6NDN8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A6NDN8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NDN8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A6NDN8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A6NDN8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
A6NDN8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
A6NDN8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
A6NDN8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
A6NDN8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A6NDN8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A6NDN8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A6NDN8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A6NDN8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A6NDN8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A6NDN8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A6NDN8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A6NDN8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A6NDN8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A6NDN8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A6NDN8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A6NDN8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A6NDN8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A6NDN8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
A6NDN8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A6NDN8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A6NDN8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
A6NDN8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
A6NDN8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
A6NDN8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A6NDN8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms