Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EME2A4GXA9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EME2A4GXA9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EME2A4GXA9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EME2A4GXA9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EME2A4GXA9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EME2A4GXA9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EME2A4GXA9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EME2A4GXA9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EME2A4GXA9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EME2A4GXA9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EME2A4GXA9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EME2A4GXA9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EME2A4GXA9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EME2A4GXA9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EME2A4GXA9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EME2A4GXA9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EME2A4GXA9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EME2A4GXA9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
EME2A4GXA9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EME2A4GXA9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EME2A4GXA9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EME2A4GXA9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EME2A4GXA9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EME2A4GXA9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EME2A4GXA9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EME2A4GXA9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EME2A4GXA9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EME2A4GXA9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EME2A4GXA9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EME2A4GXA9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EME2A4GXA9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EME2A4GXA9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EME2A4GXA9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EME2A4GXA9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EME2A4GXA9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EME2A4GXA9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EME2A4GXA9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EME2A4GXA9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EME2A4GXA9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EME2A4GXA9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EME2A4GXA9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EME2A4GXA9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EME2A4GXA9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EME2A4GXA9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EME2A4GXA9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EME2A4GXA9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EME2A4GXA9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EME2A4GXA9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EME2A4GXA9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EME2A4GXA9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EME2A4GXA9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EME2A4GXA9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EME2A4GXA9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EME2A4GXA9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EME2A4GXA9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EME2A4GXA9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EME2A4GXA9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EME2A4GXA9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EME2A4GXA9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EME2A4GXA9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EME2A4GXA9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EME2A4GXA9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EME2A4GXA9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EME2A4GXA9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EME2A4GXA9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EME2A4GXA9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EME2A4GXA9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EME2A4GXA9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EME2A4GXA9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EME2A4GXA9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EME2A4GXA9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EME2A4GXA9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EME2A4GXA9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EME2A4GXA9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EME2A4GXA9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EME2A4GXA9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EME2A4GXA9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EME2A4GXA9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EME2A4GXA9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EME2A4GXA9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EME2A4GXA9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EME2A4GXA9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EME2A4GXA9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EME2A4GXA9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EME2A4GXA9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EME2A4GXA9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EME2A4GXA9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EME2A4GXA9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EME2A4GXA9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EME2A4GXA9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EME2A4GXA9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EME2A4GXA9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EME2A4GXA9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EME2A4GXA9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EME2A4GXA9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EME2A4GXA9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EME2A4GXA9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EME2A4GXA9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EME2A4GXA9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms