Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TTC26A0AVF1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TTC26A0AVF1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TTC26A0AVF1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TTC26A0AVF1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TTC26A0AVF1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TTC26A0AVF1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TTC26A0AVF1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TTC26A0AVF1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TTC26A0AVF1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TTC26A0AVF1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TTC26A0AVF1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TTC26A0AVF1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TTC26A0AVF1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TTC26A0AVF1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TTC26A0AVF1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TTC26A0AVF1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TTC26A0AVF1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TTC26A0AVF1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TTC26A0AVF1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TTC26A0AVF1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TTC26A0AVF1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TTC26A0AVF1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TTC26A0AVF1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TTC26A0AVF1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TTC26A0AVF1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TTC26A0AVF1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
TTC26A0AVF1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TTC26A0AVF1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TTC26A0AVF1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TTC26A0AVF1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TTC26A0AVF1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TTC26A0AVF1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TTC26A0AVF1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TTC26A0AVF1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TTC26A0AVF1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TTC26A0AVF1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TTC26A0AVF1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TTC26A0AVF1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
TTC26A0AVF1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TTC26A0AVF1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TTC26A0AVF1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TTC26A0AVF1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TTC26A0AVF1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TTC26A0AVF1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TTC26A0AVF1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TTC26A0AVF1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TTC26A0AVF1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TTC26A0AVF1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TTC26A0AVF1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TTC26A0AVF1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TTC26A0AVF1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TTC26A0AVF1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TTC26A0AVF1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TTC26A0AVF1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TTC26A0AVF1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TTC26A0AVF1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TTC26A0AVF1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TTC26A0AVF1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TTC26A0AVF1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TTC26A0AVF1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TTC26A0AVF1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TTC26A0AVF1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TTC26A0AVF1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TTC26A0AVF1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TTC26A0AVF1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TTC26A0AVF1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TTC26A0AVF1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TTC26A0AVF1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TTC26A0AVF1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TTC26A0AVF1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TTC26A0AVF1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TTC26A0AVF1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TTC26A0AVF1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TTC26A0AVF1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TTC26A0AVF1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TTC26A0AVF1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TTC26A0AVF1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TTC26A0AVF1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TTC26A0AVF1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TTC26A0AVF1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TTC26A0AVF1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TTC26A0AVF1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TTC26A0AVF1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TTC26A0AVF1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TTC26A0AVF1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TTC26A0AVF1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TTC26A0AVF1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TTC26A0AVF1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TTC26A0AVF1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TTC26A0AVF1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TTC26A0AVF1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TTC26A0AVF1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TTC26A0AVF1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TTC26A0AVF1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TTC26A0AVF1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TTC26A0AVF1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TTC26A0AVF1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TTC26A0AVF1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TTC26A0AVF1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
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