Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GX30

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GX30 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A1B0GX30 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1B0GX30 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1B0GX30 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1B0GX30 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1B0GX30 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1B0GX30 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1B0GX30 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1B0GX30 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1B0GX30 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1B0GX30 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1B0GX30 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1B0GX30 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1B0GX30 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1B0GX30 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1B0GX30 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1B0GX30 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1B0GX30 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1B0GX30 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1B0GX30 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1B0GX30 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1B0GX30 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1B0GX30 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1B0GX30 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1B0GX30 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1B0GX30 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GX30 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GX30 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GX30 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GX30 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1B0GX30 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1B0GX30 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GX30 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GX30 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GX30 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GX30 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GX30 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GX30 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GX30 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GX30 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GX30 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GX30 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GX30 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GX30 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GX30 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GX30 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GX30 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GX30 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GX30 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GX30 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GX30 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GX30 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GX30 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GX30 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GX30 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GX30 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GX30 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GX30 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GX30 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GX30 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GX30 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GX30 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GX30 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GX30 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GX30 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GX30 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GX30 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GX30 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GX30 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GX30 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GX30 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GX30 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GX30 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GX30 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GX30 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GX30 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GX30 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GX30 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GX30 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GX30 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GX30 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GX30 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GX30 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GX30 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms