Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS06

TRBV23-1, T-cell receptor beta variable 23-1 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV23-1A0A0A0MS06 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV23-1A0A0A0MS06 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV23-1A0A0A0MS06 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV23-1A0A0A0MS06 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBV23-1A0A0A0MS06 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBV23-1A0A0A0MS06 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBV23-1A0A0A0MS06 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBV23-1A0A0A0MS06 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRBV23-1A0A0A0MS06 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRBV23-1A0A0A0MS06 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRBV23-1A0A0A0MS06 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRBV23-1A0A0A0MS06 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV23-1A0A0A0MS06 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV23-1A0A0A0MS06 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV23-1A0A0A0MS06 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV23-1A0A0A0MS06 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV23-1A0A0A0MS06 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBV23-1A0A0A0MS06 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBV23-1A0A0A0MS06 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV23-1A0A0A0MS06 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBV23-1A0A0A0MS06 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBV23-1A0A0A0MS06 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBV23-1A0A0A0MS06 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV23-1A0A0A0MS06 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV23-1A0A0A0MS06 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV23-1A0A0A0MS06 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV23-1A0A0A0MS06 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV23-1A0A0A0MS06 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV23-1A0A0A0MS06 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV23-1A0A0A0MS06 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV23-1A0A0A0MS06 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV23-1A0A0A0MS06 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV23-1A0A0A0MS06 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBV23-1A0A0A0MS06 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBV23-1A0A0A0MS06 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRBV23-1A0A0A0MS06 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRBV23-1A0A0A0MS06 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV23-1A0A0A0MS06 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV23-1A0A0A0MS06 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV23-1A0A0A0MS06 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV23-1A0A0A0MS06 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV23-1A0A0A0MS06 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV23-1A0A0A0MS06 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV23-1A0A0A0MS06 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV23-1A0A0A0MS06 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV23-1A0A0A0MS06 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRBV23-1A0A0A0MS06 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRBV23-1A0A0A0MS06 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV23-1A0A0A0MS06 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV23-1A0A0A0MS06 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV23-1A0A0A0MS06 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRBV23-1A0A0A0MS06 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRBV23-1A0A0A0MS06 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRBV23-1A0A0A0MS06 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRBV23-1A0A0A0MS06 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRBV23-1A0A0A0MS06 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRBV23-1A0A0A0MS06 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV23-1A0A0A0MS06 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV23-1A0A0A0MS06 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV23-1A0A0A0MS06 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBV23-1A0A0A0MS06 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBV23-1A0A0A0MS06 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBV23-1A0A0A0MS06 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBV23-1A0A0A0MS06 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBV23-1A0A0A0MS06 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBV23-1A0A0A0MS06 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBV23-1A0A0A0MS06 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBV23-1A0A0A0MS06 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBV23-1A0A0A0MS06 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBV23-1A0A0A0MS06 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBV23-1A0A0A0MS06 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBV23-1A0A0A0MS06 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV23-1A0A0A0MS06 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV23-1A0A0A0MS06 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV23-1A0A0A0MS06 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV23-1A0A0A0MS06 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV23-1A0A0A0MS06 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV23-1A0A0A0MS06 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV23-1A0A0A0MS06 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV23-1A0A0A0MS06 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV23-1A0A0A0MS06 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV23-1A0A0A0MS06 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV23-1A0A0A0MS06 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV23-1A0A0A0MS06 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV23-1A0A0A0MS06 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV23-1A0A0A0MS06 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1070.4 ms