Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K3

PCYT1B, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1BQ9Y5K3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCYT1BQ9Y5K3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms