Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG4BQ9Y4P1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms