Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms