Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLIP2Q9UDT6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLIP2Q9UDT6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms