Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms